Protection from Omicron infection in residents of nursing and retirement homes in Ontario, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Objectives To identify factors that contribute to protection from infection with the Omicron variant of SARS-CoV-2 in older adults in nursing and retirement homes. Design Longitudinal cohort study with retrospective analysis of infection risk. Setting and Participants 997 residents of nursing and retirement homes from Ontario, Canada, in the COVID-in-LTC study. Methods Residents with three mRNA dose vaccinations were included in the study. SARS-CoV-2 infection was determined by positive nasopharyngeal PCR test and/or circulating anti-nucleocapsid IgG antibodies. Cumulative probability of Omicron infection after recent COVID-19 was assessed by log-rank test of Kaplan-Meier curves. Cox regression was used to assess risk of Omicron infection by age, sex, mRNA vaccine combination, whether individuals received a fourth dose, as well as recent COVID-19. Results 171 residents (17.2%) had a presumed Omicron variant SARS-CoV-2 infection between December 15, 2021 (local start of the first Omicron wave) and May 3, 2022. Risk of Omicron infection was not different by age [hazard ratio (95% confidence interval): 1.01 (0.99-1.02)], or in women compared to men [0.97 (0.70-1.34)], but infection risk decreased 47% with three vaccine doses of mRNA-1273 (Moderna) compared to BNT162b2 (Pfizer) [0.53 (0.31-0.90)], 81% with any fourth mRNA vaccine dose [0.19 (0.12-0.30)], and 48% with SARS-CoV-2 infection in the 3 months prior to beginning of the Omicron wave [0.52, (0.27-0.99)]. Conclusions and Implications Vaccine type (i.e., mRNA-1273/Spikevax vs BNT162b2/Cominarty), any fourth vaccine dose, and hybrid immunity from recent COVID-19, were protective against infection with the Omicron variant. These data emphasize the importance of vaccine type, and number of vaccine doses, in maintenance of protective immunity and reduction of risk of Omicron variant breakthrough infection. These findings promote continued public health efforts to support vaccination programs and monitor vaccine immunogenicity in older adults. Brief summary Risk of infection with the SARS-CoV-2 Omicron variant in older adults in early 2022 was reduced with triple mRNA-1273 vaccination, any fourth dose vaccine, and within three months of prior COVID-19.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».