Multicenter evaluation of the IL‐3‐pSTAT5 assay to assess the potency of cryopreserved stem cells from cord blood units: The BEST Collaborative study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The IL-3-pSTAT5 assay, a new, rapid, and standardized flow-cytometry-based assay may compensate for several limitations of the colony-forming unit (CFU) assay typically used for stem cell potency assessments of cord blood units (CBU). We performed an inter-laboratory evaluation of the performance of this new assay. STUDY DESIGN AND METHODS: This Biomedical Excellence for Safer Transfusion (BEST) Collaborative multicenter, international study included 15 participants from public cord blood banks (CBBs), CBB-supporting research laboratories, and stem cell laboratories. To perform the IL-3-pSTAT5 assay, participating centers received reagents, instructions, and 10 blind CBU samples, including eight normal samples and two samples exposed to a transient warming event. We measured inter-laboratory agreement qualitatively (proportion of correctly classified samples) and quantitatively (coefficient of variation [CV], correlation coefficients, receiver operating characteristics (ROC) curve, and intraclass correlation coefficient [ICC]). RESULTS: The qualitative agreement was 97.3% (i.e., 107/110; Fleiss' kappa = 0.835). The average CV on a per-sample basis was 11.57% among all samples, 8.99% among normal samples, and on a per-center basis was 9.42% among normal samples. In a correlation matrix that compared results across centers, the mean Pearson's correlation coefficient was 0.88 (standard deviation = 0.04). The ICC was 0.83 (95% confidence interval = 0.68-0.95). The area under the curve (AUC) from the ROC curve was 0.9974. DISCUSSION: Excellent qualitative and quantitative agreement was exhibited across laboratories. The IL-3-pSTAT5 assay may therefore be implemented in flow cytometry laboratories to rapidly and reliably provide standardized measures of stem cell potency in CBUs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,076 | 0,042 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».