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Enregistrement W4283775775 · doi:10.1038/s41523-022-00442-w

The different prognostic significance of polysialic acid and CD56 expression in tumor cells and lymphocytes identified in breast cancer

2022· article· en· W4283775775 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

Revuenpj Breast Cancer · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensBC Cancer AgencyVancouver General HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCongressionally Directed Medical Research ProgramsCanadian Glycomics NetworkNetworks of Centres of Excellence of CanadaMichael Smith Health Research BCSusan G. KomenGovernment of CanadaU.S. Department of Defense
Mots-clésPolysialic acidBreast cancerCancer researchCancerMedicineInternal medicineOncologyBiologyCellNeural cell adhesion moleculeGeneticsCell adhesion

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protein glycosylation, the attachment of carbohydrates onto proteins, is a fundamental process that alters the biological activity of proteins. Changes to glycosylation states are associated with many forms of cancer including breast cancer. Through immunohistological analysis of breast cancer patient tumors, we have discovered the expression of an atypical glycan-polysialic acid (polySia)-in breast cancer. Notably, we have identified polySia expression in not only tumor cells but also on tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) and our study reveals ST8Sia4 as the predominant polysialyltransferase expressed. Evaluation of ST8Sia4 expression in tumor cells identified an association between high expression levels and poor patient outcomes whereas ST8Sia4 expression in infiltrating stromal cells was associated with good patient outcomes. Investigation into CD56, a protein known to be polysialylated, found CD56 and polySia expression on breast tumor cells and TILs. CD56 expression did not positively correlate with polySia expression except in patient tumors which expressed HER2. In these HER2 expressing tumors, CD56 expression was significantly associated with HER2 expression score. Evaluation of CD56 tumor cell expression identified a significant association between CD56 expression and poor patient outcomes. By contrast, CD56 expression on TILs was significantly associated with good clinical outcomes. Tumors with CD56+ TILs were also consistently polySia TIL positive. Interestingly, in tumors where TILs were CD56 low-to-negative, a polySia+ lymphocyte population was still identified and the presence of these lymphocytes was a poor prognostic indicator. Overall, this study provides the first detailed report of polySia and CD56 in breast cancer and demonstrates that the prognostic significance is dependent on the cell type expression within the tumor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,500
Score d'incertitude au seuil0,393

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle