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Enregistrement W4283780716 · doi:10.1101/2022.06.28.497834

Modelling Instantaneous Firing Rate of DBS Target Neuronal Ensembles in Basal Ganglia and Thalamus

2022· preprint· en· W4283780716 sur OpenAlexafffund
Yupeng Tian, Matthew J. H. Murphy, Leon A Steiner, Suneil K. Kalia, Mojgan Hodaie, Andrés M. Lozano, William D. Hutchison, Popovic Milos R., Milosevic Luka, Lankarany Milad

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurological disorders and treatments
Établissements canadiensToronto Western HospitalToronto Rehabilitation InstituteUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBerlin Institute of HealthDeutsche ForschungsgemeinschaftDeutscher Akademischer Austauschdienst
Mots-clésSubthalamic nucleusDeep brain stimulationNeuroscienceBasal gangliaLocal field potentialMicroelectrodeThalamusComputer scienceNeurophysiologyEssential tremorBiological systemPhysicsParkinson's diseaseBiologyMedicineCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Objective Deep Brain Stimulation (DBS) is an effective treatment for movement disorders, including Parkinson’s disease and essential tremor. However, the underlying mechanisms of DBS remain elusive. Despite the capability of existing models in interpreting experimental data qualitatively, there are very few unified computational models that quantitatively capture the dynamics of the neuronal activity of varying stimulated nuclei—including subthalamic nucleus (STN), substantia nigra pars reticulata (SNr) and ventral intermediate nucleus (Vim)—across different DBS frequencies. Materials and Methods Both synthetic and experimental data were utilized in the model fitting; the synthetic data were generated by an established spiking neuron model that was reported in our previous work 1 , and the experimental data were provided using single-unit microelectrode recordings (MER) during DBS (microelectrode stimulation). Based on these data, we developed a novel mathematical model to represent the firing rate of neurons receiving DBS, including neurons in STN, SNr and Vim—across different DBS frequencies. In our model, the DBS pulses were filtered through a synapse model and a nonlinear transfer function to formulate the firing rate variability. For each DBS-targeted nucleus, we fitted a single set of optimal model parameters consistent across varying DBS frequencies. Results Our model accurately reproduced the firing rates observed and calculated from both synthetic and experimental data. The optimal model parameters were consistent across different DBS frequencies. Conclusion The result of our model fitting were in agreement with experimental single-unit microelectrode recording data during DBS. Reproducing neuronal firing rates of different nuclei of the basal ganglia and thalamus during DBS can be helpful to further understand the mechanisms of DBS, and to potentially optimize stimulation parameters based on their actual effects on neuronal activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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