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Enregistrement W4283787033 · doi:10.1088/2632-2153/ac7ddc

Curiosity in exploring chemical spaces: intrinsic rewards for molecular reinforcement learning

2022· article· en· W4283787033 sur OpenAlexafffund
Luca Thiede, Mario Krenn, AkshatKumar Nigam, Alán Aspuru‐Guzik

Notice bibliographique

RevueMachine Learning Science and Technology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensCanadian Institute for Advanced ResearchVector InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Resources CanadaMitacsCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAustrian Science FundCompute Canada
Mots-clésCuriosityReinforcement learningPaceChemical spaceComputer scienceSpace (punctuation)Field (mathematics)ReinforcementArtificial intelligenceHuman–computer interactionCognitive scienceDrug discoveryEngineeringPsychologyNeuroscienceBiologyBioinformaticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Computer aided design of molecules has the potential to disrupt the field of drug and material discovery. Machine learning and deep learning in particular, made big strides in recent years and promises to greatly benefit computer aided methods. Reinforcement learning is a particularly promising approach since it enables de novo molecule design, that is molecular design, without providing any prior knowledge. However, the search space is vast, and therefore any reinforcement learning agent needs to perform efficient exploration. In this study, we examine three versions of intrinsic motivation to aid efficient exploration. The algorithms are adapted from intrinsic motivation in the literature that were developed in other settings, predominantly video games. We show that the curious agents finds better performing molecules on two of three benchmarks. This indicates an exciting new research direction for reinforcement learning agents that can explore the chemical space out of their own motivation. This has the potential to eventually lead to unexpected new molecular designs no human has thought about so far.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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