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Enregistrement W4283791301 · doi:10.1111/ene.15484

Mitochondrial <scp>DNA</scp> variant spectrum and the association with chronic tic disorders

2022· article· en· W4283791301 sur OpenAlexaff
Peifang Jiang, Tao Zhu, Jiajing Liu, Xiaohan Tao, Ziru Xue, Yiling Tao, Hongyu Chen, Xiaojing Zeng, Weiyi Zhu, Qiang Shu, Lan Yu

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neurology · 2022
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueObsessive-Compulsive Spectrum Disorders
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesZhejiang Province Public Welfare Technology Application Research ProjectNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMitochondrial DNAGeneticsGeneMolecular biologyMedicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: Tic disorders (TDs) are childhood onset neuropsychiatric disorders characterized by single or multiple sudden, rapid, recurrent, and motor tics and/or vocal tics. Several nuclear genes that are involved in mitochondrial functions suggest a potential role of mitochondria in TDs. METHODS: To evaluate the association of mitochondrial DNA (mtDNA) variants with TDs, we screened the whole mitochondrial genomes in 493 TD patients and 109 age- and sex-matched healthy controls using next generation sequencing technology. RESULTS: A total of 1918 mtDNA variants including 1220 variants in patients only, 154 variants in controls only, and 544 variants shared by both cases and controls were identified. We found a higher number of overall mtDNA variants in TD patients (p = 0.00028). The variant density in MT-ATP6/8 and MT-CYB coding regions showed a significant difference between TD patients and controls (p = 0.0025 and p = 0.003, respectively). Furthermore, we observed a significant association of 15 common variants with TD based on an additive model, including m.14766C &gt; T, m.14783 T &gt; C, m.14905G &gt; A, and m.15301G &gt; A in MT-CYB; m.4769A &gt; G, m.10398A &gt; G, m.12705C &gt; T, and m.12850A &gt; G in MT-ND genes; m.7028C &gt; T in MT-CO1; m.8701A &gt; G in MT-ATP6; two variants with m.16223C &gt; T, m.5580 T &gt; C in noncoding regions; and three rRNA variants with m.1438A &gt; G and m.750A &gt; G in RNR1, and m.2352 T &gt; C in RNR2. CONCLUSIONS: Our data provide evidence of mtDNA variants associated with TDs. The accumulation of the heteroplasmic levels may increase the risk of TDs. Replication studies with larger samples are necessary to understand the pathogenesis of TDs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,267
Score d'incertitude au seuil0,672

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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