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Enregistrement W4283795705 · doi:10.3389/fimmu.2022.901111

White Spot Syndrome Virus Triggers a Glycolytic Pathway in Shrimp Immune Cells (Hemocytes) to Benefit Its Replication

2022· article· en· W4283795705 sur OpenAlexfundno aff
Yen Siong Ng, Der‐Yen Lee, Chun‐Hung Liu, Cheng-Yi Tung, Shuting He, Han‐Ching Wang

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueInvertebrate Immune Response Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cheng Kung UniversityMinistry of Science and Technology, TaiwanUniversity of Calgary
Mots-clésGlycolysisWhite spot syndromePhosphofructokinaseBiologyHexokinaseViral replicationPyruvate kinaseVirusShrimpCell biologyGene silencingAnaerobic glycolysisVirologyEnzymeBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

White spot syndrome virus (WSSV) is the causative agent of a shrimp disease that inflicts in huge economic losses in shrimp-farming industry. WSSV triggers aerobic glycolysis in shrimp immune cells (hemocytes), but how this virus regulates glycolytic enzymes or pathway is yet to be characterized. Therefore, mRNA levels and activity of four important glycolytic enzymes, Hexokinase (HK), Phosphofructokinase (PFK), Pyruvate kinase (PK), and Lactate dehydrogenase (LDH), were measured in WSSV-infected shrimp hemocytes. Gene expression of HK and PFK, but not LDH or PK, was increased at the viral genome replication stage (12 hpi); furthermore, activity of these enzymes, except HK, was concurrently increased. However, there was no increased enzyme activity at the viral late stage (24 hpi). In vivo dsRNA silencing and glycolysis disruption by 2-DG further confirmed the role of glycolysis in virus replication. Based on tracing studies using stable isotope labeled glucose, glycolysis was activated at the viral genome replication stage, but not at the viral late stage. This study demonstrated that WSSV enhanced glycolysis by activating glycolytic enzyme at the viral genome replication stage, providing energy and biomolecules for virus replication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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