Assessing population genetic structure of three New Zealand stream insects using mitochondrial and nuclear DNA markers
Notice bibliographique
Résumé
Assessing genetic differentiation among natural populations can aid understanding of dispersal patterns and connectivity among habitats. Several molecular markers have become increasingly popular in determining population genetic structure for this purpose. Here, we compared the resolution of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) and nuclear single nucleotide polymorphism (SNP) markers for detecting population structure among stream insects at small spatial scales. Individuals of three endemic taxa— Coloburiscus humeralis (Ephemeroptera), Zelandobius confusus (Plecoptera), and Hydropsyche fimbriata (Trichoptera)—were collected from forested streams that flow across open pasture in the North Island of New Zealand. Both COI and SNP data indicated limited population structure across the study area, and small differences observed among these species were likely related to their putative dispersal abilities. For example, fine-scale genetic differentiation between and among neighbouring stream populations for H. fimbriata suggests that gene flow, and hence dispersal, may be more limited for this species relative to the others. Based on the generally similar results provided by both types of markers, we suggest that either COI or SNP markers can provide suitable initial estimates of fine-scale population genetic differentiation in stream insects.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».