Childhood cancer mutagenesis caused by a domesticated DNA transposase
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Genomic rearrangements are a hallmark of most solid tumors, including medulloblastoma, one of the most common brain tumors in children. Childhood cancers involve dysregulated cell development, but their mutational causes remain largely unknown. One of the most common forms of medulloblastoma is caused by ectopic activation of Sonic Hedgehog (SHH) signaling in cerebellar granule cell progenitors, associated with genetic deletions, amplifications, and other oncogenic chromosomal rearrangements. Here, we show that PiggyBac Transposable Element Derived 5 (Pgbd5) promotes tumor development in multiple developmentally-accurate mouse models of SHH medulloblastoma. Most mice with Pgbd5 deficiency do not develop tumors, while Pgbd5 -deficient mice maintain largely normal cerebellar development. Mouse medulloblastomas expressing Pgbd5 exhibit significantly increased numbers of somatic structural DNA rearrangements, with PGBD5-specific transposon sequences at their breakpoints. Similar sequence breakpoints recurrently affect somatic DNA rearrangements of known tumor suppressors and oncogenes in medulloblastomas in 329 children. Therefore, this study identifies PGBD5 as a primary medulloblastoma mutator and provides a genetic mechanism responsible for the generation of somatic oncogenic DNA rearrangements in childhood cancer. One-Sentence Summary Induction of somatic oncogenic mutations by the DNA transposase PGBD5 in cerebellar progenitor cells promotes medulloblastoma development.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».