SoyMAGIC: An Unprecedented Platform for Genetic Studies and Breeding Activities in Soybean
Notice bibliographique
Résumé
L.). We have established an eight-parent MAGIC population, comprising 721 recombinant inbred lines (RILs), through conical inter-mating of eight soybean lines. The parental lines were genetically diverse elite cultivars carrying different agronomic and seed composition characteristics, including amino acids and fatty acids, as well as oil and protein concentrations. This study aimed to introduce soybean MAGIC (SoyMAGIC) population as an unprecedented platform for genotypic and phenotypic investigation of agronomic and seed quality traits in soybean. The RILs were evaluated for important seed composition traits using replicated field trials during 2020 and 2021. To measure the seed composition traits, near-infrared reflectance (NIR) was employed. The RILs were genotyped using genotyping-by-sequencing (GBS) method to decipher the genome and discover single-nucleotide polymorphic (SNP) markers among the RILs. A high-density linkage map was constructed through inclusive composite interval mapping (ICIM). The linkage map was 3,770.75 cM in length and contained 12,007 SNP markers. Chromosomes 11 and 18 were recorded as the shortest and longest linkage groups with 71.01 and 341.15 cM in length, respectively. Observed transgressive segregation of the selected traits and higher recombination frequency across the genome confirmed the capability of MAGIC population in reshuffling the diversity in the soybean genome among the RILs. The assessment of haplotype blocks indicated an uneven distribution of the parents' genomes in RILs, suggesting cryptic influence against or in favor of certain parental genomes. The SoyMAGIC population is a recombined genetic material that will accelerate further genomic studies and the development of soybean cultivars with improved seed quality traits through the development and implementation of reliable molecular-based toolkits.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».