Neural Query Synthesis and Domain-Specific Ranking Templates for Multi-Stage Clinical Trial Matching
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
In this work, we propose an effective multi-stage neural ranking system for the clinical trial matching problem. First, we introduce NQS, a neural query synthesis method that leverages a zero-shot document expansion model to generate multiple sentence-long queries from lengthy patient descriptions. These queries are independently issued to a search engine and the results are fused. We find that on the TREC 2021 Clinical Trials Track, this method outperforms strong traditional baselines like BM25 and BM25 + RM3 by about 12 points in [email protected], a relative improvement of 34%. This simple method is so effective that even a state-of-the-art neural relevance ranking method trained on the medical subset of MS MARCO passage, when reranking the results of NQS, fails to improve on the ranked list. Second, we introduce a two-stage neural reranking pipeline trained on clinical trial matching data using tailored ranking templates. In this setting, we can train a pointwise reranker using just 1.1k positive examples and obtain effectiveness improvements over NQS by 24 points. This end-to-end multi-stage system demonstrates a 20% relative effectiveness gain compared to the second-best submission at TREC 2021, making it an important step towards better automated clinical trial matching.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle