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Enregistrement W4284714508 · doi:10.1101/2022.07.05.22277238

Genome-wide association meta-analysis of spontaneous coronary artery dissection reveals common variants and genes related to artery integrity and tissue-mediated coagulation

2022· preprint· en· W4284714508 sur OpenAlexaff
David Adlam, Takiy-Eddine Berrandou, Adrien Georges, Christopher P. Nelson, Eleni Giannoulatou, Joséphine Henry, Lijiang Ma, Montgomery Blencowe, Tamiel N. Turley, Min‐Lee Yang, Peter S. Braund, Inès Sadeg-Sayoud, Siiri E. Iismaa, Matthew Kosel, Xiang Zhou, Stephen E. Hamby, Jenny Cheng, Lu Liu, Ingrid Tarr, David W.M. Muller, Valentina d’Escamard, Annette King, Liam R. Brunham, Ania A. Baranowska-Clarke, Stéphanie Debette, Philippe Amouyel, Jeffrey W. Olin, Snehal Patil, Stephanie Hesselson, Keerat Junday, Stavroula Kanoni, Krishna G. Aragam, Adam S. Butterworth, Marysia S. Tweet, Rajiv Gulati, Nicolas Combaret, Daniella Kadian‐Dodov, J. Kálmán, Diane Fatkin, Jacqueline Saw, Tom R. Webb, Sharonne N. Hayes, Xia Yang, Santhi K. Ganesh, Timothy M. Olson, Jason C. Kovacic, Robert M. Graham, Nilesh J. Samani

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiovascular Issues in Pregnancy
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesSociété Française de CardiologieBritish Heart FoundationFédération Française de CardiologieNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésScadCoronary artery diseaseGenome-wide association studyMyocardial infarctionBiologyExtracellular matrixOdds ratioInternal medicineCardiologyMedicineBioinformaticsGeneticsGeneSingle-nucleotide polymorphismGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Spontaneous coronary artery dissection (SCAD) is an understudied cause of acute myocardial infarction primarily affecting women. It is not known to what extent SCAD is genetically distinct from other cardiovascular diseases, including atherosclerotic coronary artery disease (CAD). Through a meta-analysis of genome-wide association studies including 1917 cases and 9292 controls of European ancestry, we identified 17 risk loci, including 12 new, with odds ratios ranging from 2.04 (95%CI 1.77-2.35) on chr21 to 1.25 (95%CI 1.16-1.35) on chr4. A locus on chr1 containing the tissue factor gene ( F3 ), which is involved in blood coagulation cascade, appears to be specific for SCAD risk. Prioritized genes were mainly expressed in vascular smooth muscle cells and fibroblasts of arteries and are implicated predominantly in extracellular matrix biology (e.g. COL4A1/A2, HTRA1 and TIMP3 ). We found that several variants associated with SCAD had diametrically opposite associations with CAD suggesting that shared biological processes contribute to both diseases but through different mechanisms. We also demonstrated an inferred causal role for high blood pressure, but not other CAD risk factors, in SCAD. Our findings provide novel pathophysiological insights involving arterial integrity and tissue-mediated coagulation in SCAD and set the stage for future specific therapeutics and prevention for this disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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