Regulation of TRIB1 abundance in hepatoma models
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Tribbles related homolog 1 (TRIB1) contributes to lipid and glucose homeostasis by facilitating the degradation of cognate cargos by the proteasome. We previously reported that TRIB1 was unstable in non-hepatic cellular models. Moreover, inclusion of proteasome inhibitors failed to prevent TRIB1 loss, consistent with the involvement of proteasome independent degradative processes. In view of the key role of TRIB1 in liver function, we continue our exploration of TRIB1 regulation pathways in two commonly used human hepatocyte models, HuH-7 and HepG2 cells. Proteasome inhibitors potently upregulated both endogenous and recombinant TRIB1 mRNA and protein levels. Increased transcript abundance was independent of MAPK activation while ER stress was a relatively mild inducer. Despite increasing TRIB1 protein abundance and stabilizing bulk ubiquitination, proteasome inhibition failed to stabilize TRIB1, pointing to the predominance of proteasome independent protein degradation processes controlling TRIB1 protein abundance in hepatomas. Proteasome inhibition via downregulation of its PSMB3 regulatory subunit, in contrast to its chemical inhibition, had minimal impact on TRIB1 levels. Moreover, immunoprecipitation experiments showed no evidence of TRIB1 ubiquitination. Cytoplasmic retained TRIB1 was unstable, indicating that TRIB1 lability is regulated prior to its nuclear import. Substitution of the TRIB1 PEST-like region with a GST helical region or N-terminal deletions failed to fully stabilize TRIB1. Finally, inclusion of protease or autophagy inhibitors in vivo did not rescue TRIB1 stability. This work excludes proteasome-mediated degradation as a significant contributor to TRIB1 instability and identifies transcriptional regulation as a prominent mechanism regulating TRIB1 abundance in liver models in response to proteasome inhibition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».