Habitat connectivity, gene flow, and population genetic structure in a Neotropical understory insectivore, the Rufous-and-white Wren
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Among tropical organisms, heightened habitat specialization, limited natal dispersal, and strong philopatry suggest that many species may experience reduced rates of gene flow. Diverse forms of barriers, including geographic, ecological, and behavioral barriers, further promote genetic divergence among tropical bird populations. Here, we extend our comprehension of gene flow in tropical birds by examining population genetic structure in a widespread insectivorous songbird of the Neotropics, the Rufous-and-white Wren (Thryophilus rufalbus). We explore the effects of geographic distance and habitat connectivity on genetic structure using 10 microsatellite loci, and nuclear and mitochondrial sequence data. We report high levels of genetic divergence and population structure with reduced contemporary gene flow between populations over a 500-km transect in Nicaragua and Costa Rica. Mitochondrial DNA and nuclear sequence data indicate that 2 distinct mtDNA genetic groups came into contact in northwestern Costa Rica; molecular dating suggests that the genetic patterns arose as a result of Pleistocene glaciations. Geographic distance and habitat connectivity predicted genetic structure but explained a relatively low proportion of the observed contemporary genetic variation. Patterns were similar for both males and females. Our research demonstrates the deep genetic divergence in tropical birds, and that genetic differentiation can occur over a relatively short distance. For tropical birds, strong limits to gene flow likely arise as a result of limited dispersal from natal populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».