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Enregistrement W4284888094 · doi:10.1016/j.jchromb.2022.123360

Preparation and characterization of an immunoaffinity column for the selective extraction of azaspiracids

2022· article· en· W4284888094 sur OpenAlexaff
Ingunn A. Samdal, Morten Sandvik, Jennie Vu, Merii S. Sukenthirarasa, Sinthuja Kanesamurthy, Kjersti Liv Eriksen Løvberg, Jane Kilcoyne, Craig J. Forsyth, Elliott J. Wright, Christopher O. Miles

Notice bibliographique

RevueJournal of Chromatography B · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine Toxins and Detection Methods
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthSixth Framework ProgrammeNorges Miljø- og Biovitenskapelige UniversitetMarine Biotechnology ERA-NETNorges IdrettshøgskoleUniversity of MinnesotaNorges ForskningsrådEuropean CommissionOhio State University
Mots-clésChemistryChromatographyMarine toxinElutionShellfishSepharoseExtraction (chemistry)BiochemistryToxin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The presence of azaspiracids (AZAs) in shellfish may cause food poisoning in humans. AZAs can accumulate in shellfish filtering seawater that contains marine dinoflagellates such as Azadinium and Amphidoma spp. More than 60 AZA analogues have been identified, of which AZA1, AZA2 and AZA3 are regulated in Europe. Shellfish matrices may complicate quantitation by ELISA and LC-MS methods. Polyclonal antibodies have been developed that bind specifically to the C-26-C-40 domain of the AZA structure and could potentially be used for selectively extracting compounds containing this substructure. This includes almost all known analogues of AZAs, including AZA1, AZA2 and AZA3. Here we report preparation of immunoaffinity chromatography (IAC) columns for clean-up and concentration of AZAs. The IAC columns were prepared by coupling polyclonal anti-AZA IgG to CNBr-activated sepharose. The columns were evaluated using shellfish extracts, and the resulting fractions were analyzed by ELISA and LC-MS. The columns selectively bound over 300 ng AZAs per mL of gel without significant leakage, and did not retain the okadaic acid, cyclic imine, pectenotoxin and yessotoxin analogues that were present in the applied samples. Furthermore, 90-92% of the AZAs were recovered by elution with 90% MeOH, and the columns could be re-used without significant loss of performance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,841
Score d'incertitude au seuil0,280

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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