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Enregistrement W4284992187 · doi:10.1101/2022.07.06.22277331

A dataset of multi-contrast unbiased average MRI templates of a Parkinson’s disease population

2022· preprint· en· W4284992187 sur OpenAlexaffabout
Victoria Madge, Vladimir Fonov, Yiming Xiao, Lucy Zou, Courtney Jackson, Ronald B. Postuma, Alain Dagher, Edward A. Fon, D. Louis Collins

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Neuroimaging Techniques and Applications
Établissements canadiensConcordia UniversityMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFluid-attenuated inversion recoveryTemplateVoxelParkinson's diseaseContrast (vision)PopulationMagnetic resonance imagingNuclear medicineMedicineComputer scienceArtificial intelligencePathologyRadiologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Parkinson’s disease (PD) is a complex neurodegenerative disorder affecting regions such as the substantia nigra (SN), red nucleus (RN) and locus coeruleus (LC). Processing MRI data from patients with PD requires anatomical structural references for spatial normalization and structural segmentation. Extending our previous work [1][2], we present multi-contrast unbiased MRI templates using nine 3T MRI modalities: T1w, T2*w, T1-T2* fusion, R2*, T2w, PDw, fluid-attenuated inversion recovery (FLAIR), improved susceptibility-weighted imaging (CLEAR-SWI) [3], and neuromelanin-sensitive MRI (NM). Using our previous methods to build unbiased average templates [4], 1 mm isotropic voxel size templates were created, along with 0.5 mm isotropic whole brain templates and 0.3 mm isotropic templates of the midbrain. All templates were created from 126 PD patients (44 female; ages=40-87), and 17 healthy controls (13 female; ages=39-84), except the NM template, which was created from 85 PD patients and 13 controls, respectively. The dataset is available on the NIST MNI Repository via the following link: http://nist.mni.mcgill.ca/multi-contrast-pd126-and-ctrl17-templates/ .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: Jeu de données
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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