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Enregistrement W4285023981 · doi:10.20944/preprints202207.0160.v1

NIH SenNet Consortium: Mapping Senescent Cells in the Human Body to Understand Health and Disease

2022· preprint· en· W4285023981 sur OpenAlexaff
Philip D. Blood, Katy Börner, Judith Campisi, Feng Chen, Heike E. Daldrup‐Link, Phil De Jager, Li Ding, Francesca E. Duncan, Oliver Eickelberg, Rong Fan, Toren Finkel, Vesna D. Garovic, Nils Gehlenborg, Carolyn Glass, Ziv Bar‐Joseph, Pragati Katiyar, Sojin Kim, Mélanie Königshoff, George A. Kuchel, Haesung Lee, Jun Hee Lee, Jian Ma, Qin Ma, Simon Melov, Kay Metis, Ana L. Mora, Nicolas Musi, Nicola Neretti, João F. Passos, Irfan Rahman, Juan Carlos Rivera‐Mulia, Paul Robson, Mauricio Rojas, Ananda L. Roy, Birgit Schilling, Pixu Shi, Jonathan C. Silverstein, Vidyani Suryadevera, Jichun Xie, Jinhua Wang, An-Kwok Ian Wong, Laura J. Niedernhofer

Notice bibliographique

RevuePreprints.org · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensInstitute of Aging
Organismes subventionnairesOffice of Strategic CoordinationNIH Office of the DirectorCommon FundNational Institutes of Health
Mots-clésLeverage (statistics)Computational biologyComputer scienceData scienceMedicineBioinformaticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cells respond to a myriad of stressors by senescing, acquiring stable growth arrest, morphologic and metabolic changes, and a senescence-associated-secretory-phenotype (SASP). The heterogeneity of senescent cells (SnCs) and their SASP is vast, yet poorly characterized. SnCs have diverse roles in health and disease and are therapeutically targetable, making characterization of SnCs and harmonization of their nomenclature a priority. The Cellular Senescence Network (SenNet), a NIH Common Fund initiative, will leverage emerging single cell and spatial-omics to identify and map SnCs in numerous organs across the lifespan of humans and mice. A common coordinate framework will integrate the data, using validated, standardized methods, creating public 4-dimensional SnC atlases. Key SenNet deliverables include development of innovative tools/technologies to detect SnCs, biomarker discovery, common annotations to describe SnCs and extensive public data sets. The goal is to comprehensively understand and map SnCs for diagnostic and therapeutic purposes to improve human health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,052

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0130,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,160
Tête enseignante GPT0,376
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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