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Enregistrement W4285065525 · doi:10.5267/j.ccl.2022.3.003

Computational investigation of Betalain derivatives as natural inhibitor against food borne bacteria

2022· article· en· W4285065525 sur OpenAlexvenueno aff
Fahima Siddikey, Md. Abul Hasan Roni, Ajoy Kumer, Unesco Chakma, Mohammed Mahbubul Matin

Notice bibliographique

RevueCurrent Chemistry Letters · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBotanical Research and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBetalainChemistryAntimicrobialPreservativeDocking (animal)Food sciencePigmentOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Natural organic pigments such as carotenoids, betalains, anthocyanins, and carminic acid are notably found as safer food preservatives compared to other harmful synthetic chemicals. Due to glycosylation and acylation, betalains exhibit a broad-spectrum antimicrobial functionality with protection against degenerative diseases. Thus, betalains have been investigated as a potential bacterial inhibitor for food preservative applications. Initially, 36 betalain derivatives have been taken for primary screening using molecular docking. Afterward, the top ten ligands are taken for further study and analysis. The results of Prediction of Activity Spectrum of Substances (PASS) assured the antibacterial capabilities of betalains, and Lipinski's rule-of-five ensures the acceptability of the selected ligands as antibacterial inhibitors. The bacterial pathogens, such as C. botulinum (3FIE), E. coli (2ZWK), and S. typhi (3UU2) are selected for molecular docking by these betalain pigments. Furthermore, ADMET investigations and QSAR studies are performed to check insights into the bacterial inhibition process. Most active and common binding sides were observed at GLY159, ASN165, and SER166 for C. botulinum, at ASP8, LYS40, and TRP50 for E. coli; and at ARG37, GLN5, and ARG74 for S. typhi. The present study clearly shows an excellent insight towards the invention of plant-based new organic inhibitors to face the challenges of bacterial-resistant common food preservatives.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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