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Enregistrement W4285084224 · doi:10.1007/s10493-022-00724-9

Bacteria related to tick-borne pathogen assemblages in Ornithodoros cf. hasei (Acari: Argasidae) and blood of the wild mammal hosts in the Orinoquia region, Colombia

2022· article· en· W4285084224 sur OpenAlex
Juan D. Carvajal-Agudelo, Héctor E. Ramírez-Cháves, Paula A. Ossa‐López, Fredy A. Rivera‐Páez

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueExperimental and Applied Acarology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGlobal Affairs CanadaUniversidad de CaldasMount Allison University
Mots-clésBiologyFirmicutesBartonellaArgasidaeAnimal ecologyProteobacteriaTickBorreliaZoologyrelapsing feverOrnithodorosMicrobiologyIxodidaeEcology16S ribosomal RNABacteriaVirologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interest in research on soft ticks has increased in recent decades, leading to valuable insight into their role as disease vectors. The use of metagenomics-based analyses have helped to elucidate ecological factors involved in pathogen, vector, and host dynamics. To understand the main bacterial assemblages present in Ornithodoros cf. hasei and its mammalian hosts, 84 ticks and 13 blood samples from bat hosts (Chiroptera) were selected, and the 16S rRNA gene V4 region was sequenced in five pools (each one related to each host-tick pairing). Bacterial taxonomic assignment analyses were performed by comparing operational taxonomic units (OTUs) shared between ticks and their host blood. This analysis showed the presence of Proteobacteria (38.8%), Enterobacteriaceae (25%), Firmicutes (12.3%), and Actinobacteria (10.9%) within blood samples, and Rickettsiaceae (39%), Firmicutes (25%), Actinobacteria (13.1%), and Proteobacteria (9%) within ticks. Species related to potentially pathogenic genera were detected in ticks, such as Borrelia sp., Bartonella tamiae, Ehrlichia sp. and Rickettsia-like endosymbiont, and the presence of these organisms was found in all analyzed bat species (Cynomops planirostris, Molossus pretiosus, Noctilio albiventris), and O. cf. hasei. About 41-48.6% of bacterial OTUs (genera and species) were shared between ticks and the blood of bat hosts. Targeted metagenomic screening techniques allowed the detection of tick-associated pathogens for O. cf. hasei and small mammals for the first time, enabling future research on many of these pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,702
Score d'incertitude au seuil0,664

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle