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Enregistrement W4285112075 · doi:10.20517/cdr.2022.36

Base excision repair accessory factors in senescence avoidance and resistance to treatments

2022· review· en· W4285112075 sur OpenAlexafffund
Elise Vickridge, Camila Cristina Fraga Faraco, Alain Nepveu

Notice bibliographique

RevueCancer Drug Resistance · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHistone Deacetylase Inhibitors Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDNA damageSenescenceDNA repairBiologyBase excision repairOxidative stressCell biologyCancer cellCancer researchReactive oxygen speciesCancerGeneticsDNABiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cancer cells, in which the RAS and PI3K pathways are activated, produce high levels of reactive oxygen species (ROS), which cause oxidative DNA damage and ultimately cellular senescence. This process has been documented in tissue culture, mouse models, and human pre-cancerous lesions. In this context, cellular senescence functions as a tumour suppressor mechanism. Some rare cancer cells, however, manage to adapt to avoid senescence and continue to proliferate. One well-documented mode of adaptation involves increased production of antioxidants often associated with inactivation of the KEAP1 tumour suppressor gene and the resulting upregulation of the NRF2 transcription factor. In this review, we detail an alternative mode of adaptation to oxidative DNA damage induced by ROS: the increased activity of the base excision repair (BER) pathway, achieved through the enhanced expression of BER enzymes and DNA repair accessory factors. These proteins, exemplified here by the CUT domain proteins CUX1, CUX2, and SATB1, stimulate the activity of BER enzymes. The ensued accelerated repair of oxidative DNA damage enables cancer cells to avoid senescence despite high ROS levels. As a by-product of this adaptation, these cancer cells exhibit increased resistance to genotoxic treatments including ionizing radiation, temozolomide, and cisplatin. Moreover, considering the intrinsic error rate associated with DNA repair and translesion synthesis, the elevated number of oxidative DNA lesions caused by high ROS leads to the accumulation of mutations in the cancer cell population, thereby contributing to tumour heterogeneity and eventually to the acquisition of resistance, a major obstacle to clinical treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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