Genome-wide Identification and Expression Pattern Analysis of Wheat CCT Genes Family
Notice bibliographique
Résumé
CCT genes family is widely present in plants and play vital roles in plant growth and development. Bioinformation methods were used to identify the TaCCT genes at genome-wide level, a total of 80 TaCCT genes were identified. The gene structure, phylogenetic relationship, cis -elements, chromosome location and expression patterns were analyzed. Results showed that 80 TaCCT genes were unevenly distributed on wheat chromosomes, and there were 28, 24, and 28 CCT genes were distributed in A, B, and D sub-genomes respectively. Phylogenetic analysis showed that TaCCT genes could be divided into three sub-families, namely COL, CMF, and PRR, which were belonged to 13 sub-groups. Gene structure and conserved motif analysis found that the gene structure and conserved domains of the same subgroup were basically the same. Cis -acting element analysis found that a total of 16 kinds of cis -acting elements were identified in the promoter region of TaCCT genes. Gene duplication analysis showed that 60 gene pairs were formed by 64 TaCCT genes, indicated that duplication and expansion occurred during the process of evolution. Expression patterns analysis showed that the TaCCT genes were differentially expressed under different tissues and different stress conditions, indicating that the TaCCT genes played an important role in wheat growth and development, as well as in response to abiotic stress. These findings provide a theoretical basis for further research on wheat CCT genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».