A Bird’s Eye View of the Systematics of Convolvulaceae: Novel Insights From Nuclear Genomic Data
Notice bibliographique
Résumé
Convolvulaceae is a family of c. 2,000 species, distributed across 60 currently recognized genera. It includes species of high economic importance, such as the crop sweet potato ( Ipomoea batatas L.), the ornamental morning glories ( Ipomoea L.), bindweeds ( Convolvulus L.), and dodders, the parasitic vines ( Cuscuta L.). Earlier phylogenetic studies, based predominantly on chloroplast markers or a single nuclear region, have provided a framework for systematic studies of the family, but uncertainty remains at the level of the relationships among subfamilies, tribes, and genera, hindering evolutionary inferences and taxonomic advances. One of the enduring enigmas has been the relationship of Cuscuta to the rest of Convolvulaceae. Other examples of unresolved issues include the monophyly and relationships within Merremieae, the “bifid-style” clade (Dicranostyloideae), as well as the relative positions of Erycibe Roxb. and Cardiochlamyeae. In this study, we explore a large dataset of nuclear genes generated using Angiosperms353 kit, as a contribution to resolving some of these remaining phylogenetic uncertainties within Convolvulaceae. For the first time, a strongly supported backbone of the family is provided. Cuscuta is confirmed to belong within family Convolvulaceae. “Merremieae,” in their former tribal circumscription, are recovered as non-monophyletic, with the unexpected placement of Distimake Raf. as sister to the clade that contains Ipomoeeae and Decalobanthus Ooststr., and Convolvuleae nested within the remaining “Merremieae.” The monophyly of Dicranostyloideae, including Jacquemontia Choisy, is strongly supported, albeit novel relationships between genera are hypothesized, challenging the current tribal delimitation. The exact placements of Erycibe and Cuscuta remain uncertain, requiring further investigation. Our study explores the benefits and limitations of increasing sequence data in resolving higher-level relationships within Convolvulaceae, and highlights the need for expanded taxonomic sampling, to facilitate a much-needed revised classification of the family.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».