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Enregistrement W4285392923 · doi:10.1101/2022.07.13.499952

A vascular origin for pulmonary smooth muscle in the avian lung

2022· preprint· en· W4285392923 sur OpenAlexfundno aff
Katharine Goodwin, Michael A. Palmer, Bezia Lemma, Celeste M. Nelson

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaPrinceton UniversityCanadian Federation of University WomenAmerican Heart AssociationHoward Hughes Medical InstituteDivision of Civil, Mechanical and Manufacturing InnovationNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésMesenchymeBiologyVertebrateLungAnatomyEpitheliumSmooth muscleCell biologyEmbryoGeneInternal medicineEndocrinologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Lungs exhibit strikingly diverse epithelial architectures – from the branched airways of mammals to the sac-like lungs of lizards and the looped airways of birds. Across lineages, the pulmonary mesenchyme gives rise to smooth muscle that interacts with and shapes the underlying pulmonary epithelium. In mammals and lizards, pulmonary smooth muscle forms early and drives epithelial branching, whereas in birds it appears only after morphogenesis is largely complete. The developmental basis for this delay has remained unclear. Using comparative single-cell RNA sequencing, ATAC-sequencing, and imaging of mouse, anole, and chicken embryos, we found that smooth muscle in the chicken lung is transcriptionally similar to vascular, rather than visceral, smooth muscle. Strikingly, imaging revealed smooth muscle cells extending between the pulmonary vasculature and the epithelium, and surgical removal of these vessels prevented the formation of smooth muscle around the airways. The vascular transcription factor PITX2 was highly expressed in these cells and its knockdown markedly reduced smooth muscle differentiation. Taken together, these findings identify vascular smooth muscle as the developmental source of pulmonary smooth muscle in birds and establish PITX2 as a key regulator of this lineage transition, revealing an unexpected developmental and evolutionary link between the circulatory and respiratory systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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