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Enregistrement W4285394570 · doi:10.1038/s41467-022-31574-z

The HHIP-AS1 lncRNA promotes tumorigenicity through stabilization of dynein complex 1 in human SHH-driven tumors

2022· article· en· W4285394570 sur OpenAlexaff
Jasmin Bartl, Marco Antônio Zanini, Flavia Bernardi, Antoine Forget, Lena Blümel, Julie Talbot, Daniel Picard, Nan Qin, Gabriele Cancila, Qingsong Gao, Soumav Nath, Idriss Mahoungou Koumba, Marietta Wolter, François Kuonen, Maike Langini, Thomas Beez, Christopher Munoz‐Bendix, David Pauck, Viktoria Marquardt, Hua Yu, Judith Souphron, Mascha Korsch, Christina Mölders, Daniel Berger, Sarah Göbbels, Frauke-Dorothee Meyer, Björn Scheffler, Barak Rotblat, Sven Diederichs, Vijay Ramaswamy, Hiromishi Suzuki, Anthony E. Oro, Kai Stühler, Anja Stefanski, Ute Fischer, Gabriel Leprivier, Dieter Willbold, Gerhard Steger, Alexander K. Buell, Marcel Kool, Peter Lichter, Stefan M. Pfister, Paul A. Northcott, Michael D. Taylor, Arndt Borkhardt, Guido Reifenberger, Olivier Ayrault, Marc Remke

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesJosé Carreras Leukämie-StiftungCentre National de la Recherche ScientifiqueNovo NordiskDeutsche KrebshilfeInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAlliance Nationale pour les Sciences de la Vie et de la SantéSt. Baldrick's FoundationNovo Nordisk FondenKoning BoudewijnstichtingDeutsche ForschungsgemeinschaftPediatric Brain Tumor Foundation
Mots-clésGene knockdownCancer researchSonic hedgehogBiologyHedgehog signaling pathwayCell biologyMitosisApoptosisSignal transductionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most lncRNAs display species-specific expression patterns suggesting that animal models of cancer may only incompletely recapitulate the regulatory crosstalk between lncRNAs and oncogenic pathways in humans. Among these pathways, Sonic Hedgehog (SHH) signaling is aberrantly activated in several human cancer entities. We unravel that aberrant expression of the primate-specific lncRNA HedgeHog Interacting Protein-AntiSense 1 (HHIP-AS1) is a hallmark of SHH-driven tumors including medulloblastoma and atypical teratoid/rhabdoid tumors. HHIP-AS1 is actively transcribed from a bidirectional promoter shared with SHH regulator HHIP. Knockdown of HHIP-AS1 induces mitotic spindle deregulation impairing tumorigenicity in vitro and in vivo. Mechanistically, HHIP-AS1 binds directly to the mRNA of cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 (DYNC1I2) and attenuates its degradation by hsa-miR-425-5p. We uncover that neither HHIP-AS1 nor the corresponding regulatory element in DYNC1I2 are evolutionary conserved in mice. Taken together, we discover an lncRNA-mediated mechanism that enables the pro-mitotic effects of SHH pathway activation in human tumors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,296
Score d'incertitude au seuil0,583

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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