Measuring DNA Charge Transport on a Surface Using a Redox Modulated Fluorescence Intensity Strategy with DNA SAMs
Notice bibliographique
Résumé
The double stranded DNA helix has drawn great attention across different research areas. Various types of platforms have been used to study DNA charge transfer (CT) system. Two types of DNA CT platforms are considered as the most effective: the photoinduced CT in solution with assembled donor and acceptor and electrochemistry on ground state CT in a DNA self-assembled monolayer (SAM)1. We will show a new approach for the study of DNA CT on gold surface by studying the redox modulated fluorescence signal of a co-deposited double-stranded DNA assemblies labeled with Methylene Blue (MB) or AlexaFluoro488 (AF488). We demonstrate a method that can optically distinguish between the two mechanisms of the MB redox on DNA-modified surface: namely either DNA CT mediated reduction or the direct reduction of MB by the gold surface2. Given the fact that the studies on DNA-mediated electrochemistry on surface has been mainly using electrochemical measurements and we still do not fully understand the full picture of the DNA CT, we believe that this study will provide a fresh opinion and facilitate understanding on the DNA CT mechanism on electrode surface. Reference: Arnold, A. R.; Grodick, M. A.; Barton, J. K. DNA Charge Transport: From Chemical Principles to the Cell. Cell Chem. Biol. 2016, 23 (1), 183–197. Pheeney, C. G.; Barton, J. K. DNA Electrochemistry with Tethered Methylene Blue. Langmuir 2012, 28 (17), 7063–7070. Muren, N. B.; Olmon, E. D.; Barton, J. K. Solution, Surface, and Single Molecule Platforms for the Study of DNA-Mediated Charge Transport. Chem. Chem. Phys. 2012, 14 (40), 13754–13771.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».