(Invited) Designed DNA Nano-Switches As Sensitive Electrochemical Biosensors
Notice bibliographique
Résumé
Functional nucleic acid receptors (aptamers) have emerged as effective and robust recognition elements for state-of-the-art biosensors. Analytical readouts from aptamer-based biosensors (whether optical, electrochemical, or otherwise) derive primarily from global-scale conformational changes induced in the aptamer domain by analyte binding. Herein, we describe a unique biosensor design principle that represents a distinct alternative to this paradigm; particularly we demonstrate the ready applicability of this design principle in the de novo creation of electrochemical sensors for a clinical analyte of current interest. The function of the class of biosensors we describe, termed “DNA nano-switches”, is designed to depend on the integrity of duplex DNA-mediated charge transfer between an electrode and a redox label. [1] Thomas, J. M.; Chakraborty, B.; Sen, D.; Yu, H.-Z. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 13823–13833. [2] Tang, Y.; Ge, B.; Sen, D.; Yu, H.-Z. Chem. Soc. Rev. 2014, 43, 518–529 [3] Ma, F.; Qi, L.; Einarson, O.; Sen, D.; Yu, H.-Z. Anal. Chem. 2019, 91, 8244−8251. Figure 1
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,007 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».