MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4285403869 · doi:10.1016/j.matbio.2022.07.003

Phosphorylation of eIF4E in the stroma drives the production and spatial organisation of collagen type I in the mammary gland

2022· article· en· W4285403869 sur OpenAlexafffund
Samuel E.J. Preston, Margarita Bartish, Vincent R. Richard, Arash Aghigh, Christophe Gonçalves, Julian Smith-Voudouris, Fan Huang, Paméla Thébault, Aurélie Cleret‐Buhot, Réjean Lapointe, François Légaré, Lynne‐Marie Postovit, René P. Zahedi, Christoph H. Borchers, Wilson H. Miller, Sonia V. del Rincón

Notice bibliographique

RevueMatrix Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineDentistry
ThématiqueOral and Maxillofacial Pathology
Établissements canadiensResearch ManitobaUniversité de MontréalQueen's UniversityUniversité du Québec à MontréalInstitute for Research in Immunology and CancerCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill UniversityUniversity of ManitobaInstitut National de la Recherche ScientifiqueJewish General Hospital
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchVetenskapsrådetTerry Fox Research InstituteCanadian Cancer SocietyMcGill University
Mots-clésExtracellular matrixStromal cellCancer researchTumor microenvironmentPhosphorylationEIF4EMammary tumorCarcinogenesisSerineCell biologyStromaBiologyCancerChemistryBreast cancerImmunologyBiochemistryImmunohistochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The extracellular matrix (ECM) plays critical roles in breast cancer development. Whether ECM composition is regulated by the phosphorylation of eIF4E on serine 209, an event required for tumorigenesis, has not been explored. Herein, we used proteomics and mouse modeling to investigate the impact of mutating serine 209 to alanine on eIF4E (i.e., S209A) on mammary gland (MG) ECM. The proteomic data have been deposited to the ProteomeXchange Consortium via the PRIDE partner repository with the dataset identifier PXD028953. We discovered that S209A knock-in mice, expressing a non-phosphorylatable form of eIF4E, have less collagen-I deposition in native and tumor-bearing MGs, leading to altered tumor cell invasion. Additionally, phospho-eIF4E deficiency impacts collagen topology; fibers at the tumor-stroma boundary in phospho-eIF4E-deficient mice run parallel to the tumor edge but radiate outwards in wild-type mice. Finally, a phospho-eIF4E-deficient tumor microenvironment resists anti-PD-1 therapy-induced collagen deposition, correlating with an increased anti-tumor response to immunotherapy. Clinically, we showed that collagen-I and phospho-eIF4E are positively correlated in human breast cancer samples, and that stromal phospho-eIF4E expression is influenced by tumor proximity. Together, our work defines the importance of phosphorylation of eIF4E on S209 as a regulator of MG collagen architecture in the tumor microenvironment, thereby positioning phospho-eIF4E as a therapeutic target to augment response to therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,207
Score d'incertitude au seuil0,132

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMatrix BiologyMême sujetOral and Maxillofacial PathologyTravaux en français237 207