Streptococcus canis sequence type 43 may be associated with treatment failure in dogs with corneal ulceration
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To profile Streptococcus canis isolates obtained from corneal ulcers in dogs. ANIMALS: 10 dogs. PROCEDURES: Medical records were searched to identify dogs diagnosed with ulcerative keratitis by a veterinary ophthalmologist and having a positive corneal culture for S canis during the year 2020. For each case, clinical findings and outcome were determined, antimicrobial resistance and sensitivity panels were summarized, whole genome sequencing was performed, and isolates were typed using multi-locus sequence typing and genome-based proteome phylogenetic analysis. RESULTS: 10 S canis isolates were included from dogs diagnosed with ulcerative keratitis. Dogs were either treated surgically via keratectomy and conjunctival grafting (n = 6) or treated medically (4). Three of 10 corneas failed to heal and required enucleation (2/6 conjunctival grafts and 1/4 medically managed corneal ulcers). All three corneal ulcers that failed to heal were associated with S canis sequence type (ST) 43. Sequence types identified from successfully treated cases included ST8 (n = 1), ST50 (1), ST2 (2), ST27 (1), and ST15 (1). One ST43 isolate was obtained from a dog that healed following a conjunctival graft, however this was the only dog that received an oral antibiotic in addition to topical antibiotics. CLINICAL RELEVANCE: Based on this small dataset, S canis ST43 may be associated with increased virulence and contribute to conjunctival graft failure and progressive corneal collagenolysis. The postoperative administration of an oral antimicrobial may protect against conjunctival graft rejection in dogs specifically due to S canis ST43.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».