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Enregistrement W4285492964 · doi:10.1186/s12920-022-01304-x

LZTR1 molecular genetic overlap with clinical implications for Noonan syndrome and schwannomatosis

2022· review· en· W4285492964 sur OpenAlexaff
Kirsten M. Farncombe, Emily Thain, Carolina Barnett‐Tapia, Hamid Sadeghian, Raymond H. Kim

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genomics · 2022
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensSinai Health SystemOntario Institute for Cancer ResearchUniversity Health NetworkToronto General HospitalUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeurofibromatosis type 2Noonan syndromeNeurofibromatosisExomeExome sequencingNeurofibromatosesMedicineGeneticsIntellectual disabilityPathologyBiologyMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Noonan syndrome (NS) is a genetic disorder characterized by developmental delays, typical facial gestalt and cardiovascular defects. LZTR1 variants have been recently described in patients with NS and schwannomatosis, but the association, inheritance pattern and management strategy has not been fully elucidated. Here, we review the contribution of LZTR1 in NS and describe a patient with a novel, likely pathogenic variant in LZTR1. CASE PRESENTATION: A female patient was diagnosed with clinical NS at 8 months of age. She presented in adulthood when a brain and spine MRI identified plexiform neurofibromas; however, she did not meet the clinical criteria for Neurofibromatosis type 1. No pathogenic variants were identified through molecular genetic analysis of NF1, SPRED1 and a multigene NS panel. Whole exome sequencing at age 23 identified a novel de novo likely pathogenic heterozygous variant in the LZTR1 gene denoted as c.743G>A (p.Gly248Glu). Serial MRIs have shown stable imaging findings and the patient is being followed clinically by cardiology, neurology and medical genetics. CONCLUSIONS: We identified a novel mutation in the LZTR1 gene, not previously reported in association with NS. This report provides additional evidence to support for the assessment of schwannomatosis in patients with LZTR1-NS and may have overlap with Neurofibromatosis type 1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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