The Arabidopsis <scp> <i>WRR4A</i> </scp> and <scp> <i>WRR4B</i> </scp> paralogous <scp>NLR</scp> proteins both confer recognition of multiple <i>Albugo candida</i> effectors
Notice bibliographique
Résumé
Summary The oomycete Albugo candida causes white blister rust, an important disease of Brassica crops. Distinct races of A. candida are defined by their capacity to infect different host plant species. Each A. candida race encodes secreted proteins with a CX 2 CX 5 G (‘CCG’) motif that are polymorphic and show presence/absence variation, and are therefore candidate effectors . The White Rust Resistance 4 ( WRR4 ) locus in Arabidopsis thaliana accession Col‐0 contains three genes that encode intracellular nucleotide‐binding domain leucine‐rich repeat immune receptors. The Col‐0 alleles of WRR4A and WRR4B confer resistance to multiple A. candida races, although both WRR4A and WRR4B can be overcome by the Col‐0‐virulent race 4 isolate AcEx1. Comparison of CCG candidate effectors in avirulent and virulent races, and transient co‐expression of CCG effectors from four A. candida races in Nicotiana sp. or A. thaliana , revealed CCG effectors that trigger WRR4A‐ or WRR4B‐dependent hypersensitive responses. We found eight WRR4A‐recognised CCGs and four WRR4B‐recognised CCGs, the first recognised proteins from A. candida for which the cognate immune receptors in A. thaliana are known. This multiple recognition capacity potentially explains the broad‐spectrum resistance to several A. candida races conferred by WRR4 paralogues. We further show that of five tested CCGs, three confer enhanced disease susceptibility when expressed in planta , consistent with A. candida CCG proteins being effectors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».