MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4285592685 · doi:10.1158/1055-9965.epi-21-1033

Circulating Isovalerylcarnitine and Lung Cancer Risk: Evidence from Mendelian Randomization and Prediagnostic Blood Measurements

2022· article· en· W4285592685 sur OpenAlexafffund
Karl Smith-Byrne, Agustin Cerani, Florence Guida, Sirui Zhou, Antonio Agudo, Krasimira Aleksandrova, Aurelio Barricarte, Miguel Rodríguez‐Barranco, Christoph H. Bochers, Inger Torhild Gram, Jun Han, Christopher I. Amos, Rayjean J. Hung, Kjell Grankvist, Therese Haugdhal Nøst, Liher Imaz, María‐Dolores Chirlaque, Mikael Johansson, Rudolf Kaaks, Tilman Kühn, Richard M. Martin, James McKay, Valeria Pala, Hilary A. Robbins, Torkjel M. Sandanger, David Schibli, Matthias B. Schulze, Ruth C. Travis, Paolo Vineis, Elisabete Weiderpass, Paul Brennan, Mattias Johansson, J. Brent Richards

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityMount Sinai HospitalUniversity of VictoriaJewish General Hospital
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilFonds de Recherche du Québec - SantéEuropean CommissionKing's College LondonCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthCancer Research UKWellcome TrustWorld Health Organization
Mots-clésMendelian randomizationMedicineLung cancerInternal medicineOncologyCancerConfoundingPopulationGenome-wide association studyLung cancer susceptibilitySingle-nucleotide polymorphismBiologyGeneticsGenotypeEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Tobacco exposure causes 8 of 10 lung cancers, and identifying additional risk factors is challenging due to confounding introduced by smoking in traditional observational studies. MATERIALS AND METHODS: We used Mendelian randomization (MR) to screen 207 metabolites for their role in lung cancer predisposition using independent genome-wide association studies (GWAS) of blood metabolite levels (n = 7,824) and lung cancer risk (n = 29,266 cases/56,450 controls). A nested case-control study (656 cases and 1,296 matched controls) was subsequently performed using prediagnostic blood samples to validate MR association with lung cancer incidence data from population-based cohorts (EPIC and NSHDS). RESULTS: An MR-based scan of 207 circulating metabolites for lung cancer risk identified that blood isovalerylcarnitine (IVC) was associated with a decreased odds of lung cancer after accounting for multiple testing (log10-OR = 0.43; 95% CI, 0.29-0.63). Molar measurement of IVC in prediagnostic blood found similar results (log10-OR = 0.39; 95% CI, 0.21-0.72). Results were consistent across lung cancer subtypes. CONCLUSIONS: Independent lines of evidence support an inverse association of elevated circulating IVC with lung cancer risk through a novel methodologic approach that integrates genetic and traditional epidemiology to efficiently identify novel cancer biomarkers. IMPACT: Our results find compelling evidence in favor of a protective role for a circulating metabolite, IVC, in lung cancer etiology. From the treatment of a Mendelian disease, isovaleric acidemia, we know that circulating IVC is modifiable through a restricted protein diet or glycine and L-carnatine supplementation. IVC may represent a modifiable and inversely associated biomarker for lung cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,046
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,105

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,046
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Epidemiology Biomarkers & PreventionMême sujetMetabolism and Genetic DisordersTravaux en français237 207