Absence of KLK4-KLKP1 Fusion Corroborate with PTEN Loss in Characterizing Men at Higher Risk for Biochemical Recurrence in Middle Eastern Prostate Cancer Cohort
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: KLK4-KLKP1 fusion is a recently described molecular event in prostate cancer (PCa). This new biomarker has not been characterized in the Middle Eastern (ME) population. Objective: We assessed the incidence, characterization, and prognostic value of KLK4-KLKP1 fusion in a ME cohort of men with PCa and assessed the relationship of this marker to commonly known biomarkers (PTEN, ERG, SPINK1). Design, setting and participants: We interrogated a cohort of ME men with localized PCa treated by radical prostatectomy between 2005 and 2015 (n=340). KLK4-KLKP1 fusion status was assessed by RNA Chromogenic in situ hybridization (CISH) and correlated to pathological and clinical parameters.Outcome measurements and statistical analysis: RNA-CISH expression of KLK4-KLKP1 was correlated with prognostic factors, ERG, PTEN and SPINK1 expression and with biochemical recurrence (BCR) post radical prostatectomy.Results and limitations: 51.7% of patients’ samples were positive for KLK4-KLKP1; with the expression more commonly found in cores of PCa (38%) versus non-cancer (20.6%) (p <0.0001) and in lower Gleason Grade Group tumors (1-3) vs (4-5). KLK4-KLKP1 positivity was associated with ERG positivity and inversely associated with PTEN loss. No association was noticed with SPINK1 expression, seminal vesicle invasion, positive surgical margin, pathological stage, or patient age (<50 or ³ 50). When correlating to BCR, only PTEN loss was associated with BCR, and this effect became more pronounced when combined with KLK4-KLKP1 negativity (HR: 2.31, CI: 1.03-5.20, p=0.042). Conclusions: KLK4-KLKP1 expression is more common in ME vs North American (NA) populations. It is associated with ERG positivity and inversely with PTEN loss. KLK4-KLKP1 positivity showed no association with any clinical or pathological parameters, however, it demonstrated a somewhat protective effect when combined with PTEN status. Patient Summary: KLK4-KLKP1 is a newly discovered biomarker expressed in PCa with a higher incidence in the ME population. KLK4-KLKP1 positivity is associated with certain molecular subtypes (ERG-positive, PTEN intact).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».