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Enregistrement W4285595075 · doi:10.20944/preprints202207.0220.v1

HepG2-NTCP Subclones Exhibiting High Susceptibility to Hepatitis B Virus Infection

2022· preprint· en· W4285595075 sur OpenAlexaff
Muhammad Atif Zahoor, Adrian Kuipery, Alexander I. Mosa, Adam J. Gehring, Jordan J. Feld

Notice bibliographique

RevuePreprints.org · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHepatitis B virusInfectivityVirologyPermissivenessclone (Java method)BiologyIn vitroVirusViral entryViral replicationAntigenCell cultureIntracellularHepatitis BImmunologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HepG2 cells reconstituted with Hepatitis B virus (HBV) entry receptor sodium taurocholate co-transporting polypeptide (NTCP) are widely used as a convenient in vitro cell culture infection model for HBV replication studies. As such, it is pertinent that HBV infectivity is maintained at steady-state levels for accurate interpretation of in vitro data. However, variations in HBV infection efficiency due to imbalanced NTCP expression levels in the HepG2 cell line may affect experimental results. In this study, we performed single cell cloning of HepG2-NTCP-A3 parental cells via limiting dilution and obtained multiple subclones with increased permissiveness to HBV. Specifically, one subclone (HepG2-NTCP-A3/C2) yielded more than 4-fold higher HBV infection compared to the HepG2-NTCP-A3 parental clone. In addition, though HBV infectivity was universally reduced in the absence of polyethylene glycol (PEG), subclone C2 maintained relatively greater permissiveness under PEG-free conditions, suggesting the functional heterogeneity within parental HepG2-NTCP-A3 may be exploitable in developing a PEG-free HBV infection model. The increased viral production correlated with increased intracellular viral antigen expression as evidenced through HBcAg immunofluorescence staining. Further, these subclones were found to express different levels of NTCP, albeit with no remarkable morphology or cell growth differences. In conclusion, we isolated subclones of HepG2-NTCP-A3 which support efficient HBV production and thus provide an improved in vitro HBV infection model.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,202
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,007
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,116
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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