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Enregistrement W4285599841 · doi:10.1016/j.jviromet.2022.114586

An adaptable platform for in-house hepatitis C serology

2022· article· en· W4285599841 sur OpenAlexafffundabout
Jannie Pedersen, Irène Pegha Moukandja, Stella Ndidi, Anna-Louise Sørensen, Ismaël Hervé Koumakpayi, Jean-Bernard Lékana-Douki, Marie-Louise Vachon, Nina Weis, Gary Kobinger, Hugues Fausther‐Bovendo

Notice bibliographique

RevueJournal of Virological Methods · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de QuébecUniversité Laval
Organismes subventionnairesGentofte HospitalUniversité Laval
Mots-clésSerologyVirologyBiologyImmunoassayHepatitis C virusEpitopeAntibodyComputational biologyImmunologyVirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Serology-based diagnosis remains one of the major tools for diagnosis and surveillance of infectious diseases. However, for many neglected diseases no or only few commercial assays are available and often with prices prohibiting large scale testing in low and middle-income countries (LMICs). We developed an adaptable enzyme-linked immunoassay (ELISA) using hepatitis C virus (HCV) as a proof-of-concept application. By combining the maltose-binding-protein with a multiepitope HCV protein, we were able to obtain a high concentration of protein suitable for downstream applications. Following optimization, the assay was verified using previously tested human samples from Canada, Denmark and Gabon in parallel with the use of a commercial protein. Sensitivity and specificity were calculated to 98 % and 97 % respectively, after accounting for non-specific binding and assay optimization. This study provides a thorough description of the development, and validation of a multiepitope ELISA-based diagnostic assay against HCV, which could be implemented at low cost. The described methodology can be readily adapted to develop novel ELISA-based diagnostic assays for other infectious pathogens with well-described immunogenic epitopes. This method could improve the diagnosis of neglected diseases for which affordable diagnostic assays are lacking.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,469
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,151
Tête enseignante GPT0,484
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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