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Enregistrement W4285676616 · doi:10.1007/s00401-022-02468-7

X-linked myotubular myopathy is associated with epigenetic alterations and is ameliorated by HDAC inhibition

2022· article· en· W4285676616 sur OpenAlexafffund
Jonathan Volpatti, Mehdi M. Ghahramani-Seno, Mélanie Mansat, Nesrin Sabha, Ege Sarikaya, Sarah J. Goodman, Eric Chater‐Diehl, Alper Celik, Emanuela Pannia, Carine Froment, Lucie Combes‐Soia, Nika Maani, Kyoko E. Yuki, Gaëtan Chicanne, Liis Uusküla-Reimand, Simon Monis, Sana Alvi, Casie A. Genetti, Bernard Payrastre, Alan H. Beggs, Carsten G. Bönnemann, Francesco Muntoni, Michael D. Wilson, Rosanna Weksberg, Julien Viaud, James J. Dowling

Notice bibliographique

RevueActa Neuropathologica · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute for Health and Care ResearchCanadian Institutes of Health ResearchMyotubular TrustInstitute of Musculoskeletal Health and ArthritisMuscular Dystrophy AssociationJoshua Frase Foundation
Mots-clésEpigeneticsValproic AcidZebrafishPhenotypeDNA methylationBiologyGeneticsEpigenomeCancer researchGeneNeuroscienceEpilepsy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

X-linked myotubular myopathy (XLMTM) is a fatal neuromuscular disorder caused by loss of function mutations in MTM1. At present, there are no directed therapies for XLMTM, and incomplete understanding of disease pathomechanisms. To address these knowledge gaps, we performed a drug screen in mtm1 mutant zebrafish and identified four positive hits, including valproic acid, which functions as a potent suppressor of the mtm1 zebrafish phenotype via HDAC inhibition. We translated these findings to a mouse XLMTM model, and showed that valproic acid ameliorates the murine phenotype. These observations led us to interrogate the epigenome in Mtm1 knockout mice; we found increased DNA methylation, which is normalized with valproic acid, and likely mediated through aberrant 1-carbon metabolism. Finally, we made the unexpected observation that XLMTM patients share a distinct DNA methylation signature, suggesting that epigenetic alteration is a conserved disease feature amenable to therapeutic intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,367
Score d'incertitude au seuil0,877

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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