Comparative analysis reveals chromosome number reductions in the evolution of African bermudagrass (<i>Cynodon transvaalensis</i> Burtt-Davy)
Notice bibliographique
Résumé
African bermudagrass ( Cynodon transvaalensis Burtt-Davy) (2n = 2x = 18) belongs to the genus Cynodon, tribe Cynodonteae, subfamily Chloridoideae in the grass family Poaceae. The species is frequently crossed with common bermudagrass ( Cynodon dactylon Pers.) in developing high-quality hybrid turf cultivars. Molecular resources for C. transvaalensis are scarce; thus, its genomic evolution is unknown. Recently, a linkage map consisting of 1278 markers provided a powerful tool for African bermudagrass genomic research. The objective of this study was to investigate chromosome number reduction events that resulted in the nine haploid chromosomes in this species. Tag sequences of mapped single nucleotide polymorphism markers in C. transvaalensis were compared against genome sequences of Oropetium thomaeum (L.f.) Trin. (2n = 2x = 20), a genomic model in the Cynodonteae tribe. The comparative genomic analyses revealed broad collinearity between the genomes of these two species. The analyses further revealed that two major interchromosomal rearrangements of the paleochromosome ρ12 (ρ1–ρ12–ρ1 and ρ6–ρ12–ρ6) resulted in nine chromosomes in the genome of C. transvaalensis. The findings provide novel information regarding the formation of the initial diploid species in the Cynodon genus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».