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Enregistrement W4285802970 · doi:10.1093/braincomms/fcac182

Hierarchical spectral clustering reveals brain size and shape changes in asymptomatic carriers of<i>C9orf72</i>

2022· article· en· W4285802970 sur OpenAlexaff
Rose Bruffaerts, Dorothy Gors, Alicia Bárcenas Gallardo, Mathieu Vandenbulcke, Philip Van Damme, Paul Suetens, John C. van Swieten, Barbara Borroni, Raquel Sánchez‐Valle, Fermín Moreno, Robert Laforce, Caroline Graff, Matthis Synofzik, Daniela Galimberti, James B. Rowe, Mario Masellis, Maria Carmela Tartaglia, Elizabeth Finger, Alexandre de Mendonça, Fabrizio Tagliavini, Christopher Butler, Isabel Santana, Alexander Gerhard, Simon Ducharme, Johannes Levin, Adrian Danek, Markus Otto, Jonathan D. Rohrer, Patrick Dupont, Peter Claes, Rik Vandenberghe, Sònia Afonso, Maria Rosário Almeida, Sarah Anderl‐Straub, Christin Andersson, Anna Antonell, Silvana Archetti, Andrea Arighi, Mircea Balasa, Myriam Barandiarán, Núria Bargalló, Benjamin Bender, Alberto Benussi, Sandra E. Black, Martina Bocchetta, Sergi Borrego‐Écija, José Brás, Marta Cañada, Valentina Cantoni, Paola Caroppo, David M. Cash, Miguel Castelo‐Branco, Rhian S. Convery, Thomas Cope, Giuseppe Di Fede, Alina Díez, Diana Duro, Chiara Fenoglio, Catarina B. Ferreira, Nick C. Fox, Morris Freedman, Giorgio Fumagalli, Alazne Gabilondo, Roberto Gasparotti, Serge Gauthier, Stefano Gazzina, Giorgio Giaccone, Ana Gorostidi, Caroline Greaves, Rita Guerreiro, Carolin Heller, Tobias Hoegen, Begoña Indakoetxea, Vesna Jelić, Lize C. Jiskoot, Hans‐Otto Karnath, Ron Keren, Tobias Langheinrich, Maria João Leitão, Albert Lladó, Sandra Loosli, Carolina Maruta, Simon Mead, Lieke Meeter, Gabriel Miltenberger, Rick van Minkelen, Sara Mitchell, Katrina Moore, Jennifer Nicholas, Linn Öijerstedt, Jaume Olives, Sébastien Ourselin, Alessandro Padovani, Jessica Panman, Janne M. Papma, Georgia Peakman, Yolande A.L. Pijnenburg, Enrico Premi, Sara Prioni, Catharina Prix, Rosa Rademakers, Veronica Redaelli, Timothy Rittman, Ekaterina Rogaeva, Pedro Rosa‐Neto, Giacomina Rossi, Mar tin Rossor, Beatriz Santiago, Elio Scarpini, Sonja Schönecker, Elisa Semler, Rachelle Shafei, Christen Shoesmith, Miguel Tábuas‐Pereira, Mikel Tainta, Ricardo Taipa, David F. Tang‐Wai, David L. Thomas, Paul Thompson, Håkan Thonberg, Carolyn Timberlake, Pietro Tiraboschi, Emily Todd, Michele Veldsman, Ana Verdelho, Jorge Villanúa, Jason D. Warren, Carlo Wilke, Ione Woollacott, Elisabeth Wlasich, Henrik Zetterberg, Miren Zulaica

Notice bibliographique

RevueBrain Communications · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensMcGill UniversityWestern UniversityOccupational Cancer Research CentreHealth Sciences CentreMontreal Neurological Institute and HospitalUniversity of TorontoMcGill University Health CentreSunnybrook Health Science CentreUniversité Laval
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilKU LeuvenNational Institute for Health and Care ResearchBrain Research UKFonds Wetenschappelijk OnderzoekWellcome Trust
Mots-clésVoxelCluster analysisFrontotemporal dementiaFrontotemporal lobar degenerationPattern recognition (psychology)C9orf72Hierarchical clusteringArtificial intelligenceComputer scienceSegmentationDementiaPathologyMedicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Traditional methods for detecting asymptomatic brain changes in neurodegenerative diseases such as Alzheimer’s disease or frontotemporal degeneration typically evaluate changes in volume at a predefined level of granularity, e.g. voxel-wise or in a priori defined cortical volumes of interest. Here, we apply a method based on hierarchical spectral clustering, a graph-based partitioning technique. Our method uses multiple levels of segmentation for detecting changes in a data-driven, unbiased, comprehensive manner within a standard statistical framework. Furthermore, spectral clustering allows for detection of changes in shape along with changes in size. We performed tensor-based morphometry to detect changes in the Genetic Frontotemporal dementia Initiative asymptomatic and symptomatic frontotemporal degeneration mutation carriers using hierarchical spectral clustering and compared the outcome to that obtained with a more conventional voxel-wise tensor- and voxel-based morphometric analysis. In the symptomatic groups, the hierarchical spectral clustering-based method yielded results that were largely in line with those obtained with the voxel-wise approach. In asymptomatic C9orf72 expansion carriers, spectral clustering detected changes in size in medial temporal cortex that voxel-wise methods could only detect in the symptomatic phase. Furthermore, in the asymptomatic and the symptomatic phases, the spectral clustering approach detected changes in shape in the premotor cortex in C9orf72. In summary, the present study shows the merit of hierarchical spectral clustering for data-driven segmentation and detection of structural changes in the symptomatic and asymptomatic stages of monogenic frontotemporal degeneration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,173
Score d'incertitude au seuil0,459

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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