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Enregistrement W4286218289 · doi:10.1002/ppp3.10297

Coping with environmental constraints: Geographically divergent adaptive evolution and germination plasticity in the transcontinental<scp><i>Populus tremuloides</i></scp>

2022· article· en· W4286218289 sur OpenAlexafffundabout
Roos Goessen, Nathalie Isabel, Christian Wehenkel, Nathalie Pavy, Lisa Tischenko, Lyne Touchette, Isabelle Giguère, Marie‐Claude Gros‐Louis, Jérôme Laroche, Brian Boyle, Raju Soolanayakanahally, Karen E. Mock, Javier Hernández‐Velasco, Sergio Leonel Simental-Rodríguez, Jean Bousquet, Ilga Porth

Notice bibliographique

RevuePlants People Planet · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaCanadian Forest ServiceUniversité LavalNatural Resources CanadaCentre de Géomatique du Québec
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesNatural Resources CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaCompute CanadaUtah Agricultural Experiment Station
Mots-clésBiodiversityBiologyEcologyEcosystemLocal adaptationClimate changeEcological resilienceSeed dispersalBiological dispersalPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Societal Impact Statement Syntheses clearly show that global warming is affecting ecosystems and biodiversity around the world. New methods and measures are needed to predict the climate resilience of plant species critical to ecosystem stability, to improve ecological management and to support habitat restoration and human well‐being. Widespread keystone species such as aspen are important targets in the study of resilience to future climate conditions because they play a crucial role in maintaining various ecosystem functions and may contain genetic material with untapped adaptive potential. Here, we present a new framework in support of climate‐resilient revegetation based on comprehensively understood patterns of genetic variation in aspen. Summary Elucidating species' genetic makeup and seed germination plasticity is essential to inform tree conservation efforts in the face of climate change. Populus tremuloides Michx. (aspen) occurs across diverse landscapes and reaches from Alaska to central Mexico, thus representing an early‐successional model for ecological genomics. Within drought‐affected regions, aspen shows ploidy changes and/or shifts from sexual to clonal reproduction, and reduced diversity and dieback have already been observed. We genotyped over 1000 individuals, covering aspen's entire range, for approximately 44,000 single‐nucleotide polymorphisms (SNPs) to assess large‐scale and fine‐scale genetic structure, variability in reproductive type (sexual/clonal), polyploidy and genomic regions under selection. We developed and implemented a rapid and reliable analysis pipeline (FastPloidy) to assess the presence of polyploidy. To gain insights into plastic responses, we contrasted seed germination from western US and eastern Canadian natural populations under elevated temperature and water stress. Four major genetic clusters were identified range wide; a preponderance of triploids and clonemates was found within western and southern North American regions, respectively. Genomic regions involving approximately 1000 SNPs under selection were identified with association to temperature and precipitation variation. Under drought stress, western US genotypes exhibited significantly lower germination rates compared with those from eastern North America, a finding that was unrelated to differences in mutation load (ploidy). This study provided new insights into the adaptive evolution of a key indicator tree that provisions crucial ecosystem services across North America, but whose presence is steadily declining within its western distribution. We uncovered untapped adaptive potential across the species' range which can form the basis for climate‐resilient revegetation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,439

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,175
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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