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Enregistrement W4286252655 · doi:10.1016/j.celrep.2022.111092

Stress-induced perturbations in intracellular amino acids reprogram mRNA translation in osmoadaptation independently of the ISR

2022· article· en· W4286252655 sur OpenAlexafffund
Dawid Krokowski, Raul Jobava, Krzysztof J. Szkop, Chien‐Wen Chen, Fu Xu, Sarah Venus, Bo‐Jhih Guan, Jing Wu, Zhaofeng Gao, Wioleta Banaszuk, Marek Tchórzewski, Ting‐Wei Mu, Phil Ropelewski, William C. Merrick, Yuanhui Mao, Helen C. Miranda, Shu‐Bing Qian, Maria Manifava, Nicholas T. Ktistakis, Anastassios Vourekas, Eckhard Jankowsky, Ivan Topisirović, Ola Larsson, Maria Hatzoglou

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensJewish General Hospital
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNarodowe Centrum NaukiNational Institute of General Medical SciencesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthVetenskapsrådetKnut och Alice Wallenbergs StiftelseCancerfonden
Mots-clésTranslation (biology)Protein biosynthesisAmino acidCell biologyBiologyPhosphorylationMessenger RNARibosomeBiochemistryRNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The integrated stress response (ISR) plays a pivotal role in adaptation of translation machinery to cellular stress. Here, we demonstrate an ISR-independent osmoadaptation mechanism involving reprogramming of translation via coordinated but independent actions of mTOR and plasma membrane amino acid transporter SNAT2. This biphasic response entails reduced global protein synthesis and mTOR signaling followed by translation of SNAT2. Induction of SNAT2 leads to accumulation of amino acids and reactivation of mTOR and global protein synthesis, paralleled by partial reversal of the early-phase, stress-induced translatome. We propose SNAT2 functions as a molecular switch between inhibition of protein synthesis and establishment of an osmoadaptive translation program involving the formation of cytoplasmic condensates of SNAT2-regulated RNA-binding proteins DDX3X and FUS. In summary, we define key roles of SNAT2 in osmotolerance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,277

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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