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Enregistrement W4286357580 · doi:10.1177/17588359221111705

Tumor Biomarker Testing for Metastatic Colorectal Cancer: a Canadian Consensus Practice Guideline

2022· review· en· W4286357580 sur OpenAlexafffundabout
Irene Yu, Rachel Goodwin, Jonathan M. Loree, Cheryl Mather, Brandon S. Sheffield, Stephanie Snow, Sharlene Gill

Notice bibliographique

RevueTherapeutic Advances in Medical Oncology · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Treatments and Studies
Établissements canadiensBC Cancer AgencyOttawa HospitalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalQueen Elizabeth II Health Sciences CentreWilliam Osler Health SystemUniversity of AlbertaSurrey Memorial Hospital
Organismes subventionnairesPfizer CanadaAmgen CanadaThermo Scientific
Mots-clésKRASMedicineColorectal cancerBiomarkerOncologyGuidelineTargeted therapyBiomarker discoveryCancerInternal medicineBioinformaticsPathologyGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The systemic therapy management of metastatic colorectal cancer (mCRC) has evolved from primarily cytotoxic chemotherapies to now include targeted agents given alone or in combination with chemotherapy, and immune checkpoint inhibitors. A better understanding of the pathogenesis and molecular drivers of colorectal cancer not only aided the development of novel targeted therapies but led to the discovery of tumor mutations which act as predictive biomarkers for therapeutic response. Mutational status of the KRAS gene became the first genomic biomarker to be established as part of standard of care molecular testing, where KRAS mutations within exons 2, 3, and 4 predict a lack of response to anti- epidermal growth factor receptor therapies. Since then, several other biomarkers have become relevant to inform mCRC treatment; however, there are no published Canadian guidelines which reflect the current standards for biomarker testing. This guideline was developed by a pan-Canadian advisory group to provide contemporary, evidence-based recommendations on the minimum acceptable standards for biomarker testing in mCRC, and to describe additional biomarkers for consideration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,770
Score d'incertitude au seuil0,458

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0070,007
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0050,002
Intégrité de la recherche0,0040,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,134
Tête enseignante GPT0,491
Écart entre enseignants0,358 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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