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Enregistrement W4286383134 · doi:10.1139/cjm-2022-0058

Diet and ontogeny drastically alter the larval microbiome of the invertebrate model <i>Galleria mellonella</i>

2022· article· en· W4286383134 sur OpenAlexafffundvenue
Patrick Gohl, Christophe M. R. LeMoine, Bryan J. Cassone

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueInsect symbiosis and bacterial influences
Établissements canadiensBrandon University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGalleria mellonellaBiologyFirmicutesMicrobiomeLarvaProteobacteriaZoologyMicrobiologySymbiotic bacteriaEcologySymbiosisBacteria16S ribosomal RNAVirulenceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Larvae of the greater wax moth ( Galleria mellonella) are an emerging animal model to study the innate immune response and biodegradation of plastic polymers. Both of these complex biological processes are likely impacted by the plasticity of host–microbe interactions, which remains understudied in lepidopterans. Consequently, we carried out 16S rRNA sequencing to explore the effect diet (natural, artificial) has on the bacterial assemblages of G. mellonella in different tissues (gut, fat bodies, silk glands) throughout development (eggs, six instar stages, adults). The microbiome was rich in diversity, with Proteobacteria and Firmicutes being the most represented phyla. Contrary to other lepidopterans, G. mellonella appears to possess a resident microbiome dominated by Ralstonia. As larvae progress through development, the bacterial assemblages become increasingly shaped by the caterpillar's diet. In particular, a number of bacteria genera widely associated with the G. mellonella microbiome (e.g., Enterococcus and Enterbacter) were significantly enriched on an artificial diet. Overall, these results indicate that the G. mellonella microbiome is not as simplistic and homogenous as previously described. Rather, its bacterial communities are drastically affected by both diet and ontogeny, which should be taken into consideration in future studies planning to use G. mellonella as model species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,176
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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