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Enregistrement W4286462283 · doi:10.1002/cjp2.286

Spatial expression of the <scp><i>FGFR2b</i></scp> splice isoform and its prognostic significance in endometrioid endometrial carcinoma

2022· article· en· W4286462283 sur OpenAlexaffabout
Asmerom T. Sengal, Deborah S. Smith, Cameron Snell, Samuel Leung, Aline Talhouk, Elizabeth D. Williams, Jessica N. McAlpine, Pamela M. Pollock

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology Clinical Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFibroblast Growth Factor Research
Établissements canadiensCentre for Advancing Health OutcomesUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCancer Australia
Mots-clésAtypiaBiologyCancer researchEndometrial cancerStromal cellPathologyOncologyInternal medicineCancerMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endometrial carcinoma (EC) is the most common gynecological malignancy and fibroblast growth factor receptor 2 (FGFR2) is a frequently dysregulated receptor tyrosine kinase. FGFR2b and FGFR2c are the two main splice isoforms of FGFR2 and are normally localized in epithelial and mesenchymal cells, respectively. Previously, we demonstrated that FGFR2c mRNA expression was associated with aggressive tumor characteristics, shorter progression-free survival (PFS), and disease-specific survival (DSS) in endometrioid ECs (EECs). The objectives of this study were to investigate the spatial expression of FGFR2b in normal and hyperplasia with and without atypia of human endometrium and to assess the prognostic significance of FGFR2b expression in EC. FGFR2b and FGFR2c mRNA expression was evaluated in normal (proliferative [n = 10], secretory [n = 15], and atrophic [n = 10] endometrium), hyperplasia with and without atypia (n = 19) as well as two patient cohorts of EC samples (discovery [n = 78] and Vancouver [n = 460]) using isoform-specific BaseScope RNA in situ hybridization assays. Tumors were categorized based on FGFR2 isoform expression (one, both, or neither) and categories were correlated with clinicopathologic markers, molecular subtypes, and clinical outcomes. The FGFR2b splice isoform was exclusively expressed in the epithelial compartment of normal endometrium and hyperplasia without atypia. We observed FGFR2c expression at the basalis layer of glands in 33% (3/9) of hyperplasia with atypia. In patients with EEC, FGFR2b+/FGFR2c- expression was found in 48% of the discovery cohort and 35% of the validation Vancouver cohort. In univariate analyses, tumors with FGFR2b+/FGFR2c- expression had longer PFS (hazard ratio [HR] 0.265; 95% CI 0.145-0.423; log-rank p < 0.019) and DSS (HR 0.31; 95% CI 0.149-0.622; log-rank p < 0.001) compared to tumors with FGFR2b-/FGFR2c+ expression in the large EEC Vancouver cohort. In multivariable Cox regression analyses, tumors with FGFR2b+/FGFR2c- expression were significantly associated with longer DSS (HR 0.37; 95% CI 0.153-0.872; log-rank p < 0.023) compared to FGFR2b-/FGFR2c+ tumors. In conclusion, FGFR2b+/FGFR2c- expression is associated with favorable clinicopathologic markers and clinical outcomes suggesting that FGFR2b could play a role in tailoring the management of EEC patients in the clinic if these findings are confirmed in an independent cohort.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,042
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,280
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,042
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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