MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4286698097 · doi:10.1101/2022.07.20.500838

Nuanced role for dendritic cell intrinsic IRE1 RNase in the regulation of antitumor adaptive immunity

2022· preprint· en· W4286698097 sur OpenAlexfundno aff
Felipe Flores‐Santibáñez, Sofie Rennen, Dominique Fernández, Clint De Nolf, Sandra Gaete, Camila Fuentes, Carolina Moreno, Diego Figueroa, Álvaro Lladser, Takao Iwawaki, Marı́a Rosa Bono, Sophie Janssens, Fabiola Osorio

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesComisión Nacional de Investigación Científica y TecnológicaUniversity of California, San FranciscoHoward Hughes Medical InstituteAgencia Nacional de Investigación y DesarrolloSunnybrook Research InstituteUniversidad de ChileFonds Wetenschappelijk Onderzoek
Mots-clésXBP1Unfolded protein responseBiologyMelanomaCancer researchDendritic cellCell biologyOncolytic virusImmune systemImmunologyRNA splicingGeneEndoplasmic reticulumRNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The IRE1/XBPls axis of the unfolded protein response (UPR) plays divergent roles in dendritic cell (DC) biology in steady state versus tumor contexts. Whereas tumor associated DCs show dysfunctional IRE1/XBP1s activation that curtails their function, the homeostasis of conventional type 1 DCs (cDC1) in tissues requires intact IRE1 RNase activity. Considering that cDC1s are key orchestrators of antitumor immunity, it is relevant to understand the functional versus dysfunctional roles of IRE1/XBP1s in tumor DC subtypes. Here, we show that cDC1s constitutively activate IRE1 RNase within subcutaneous B16 melanoma and MC38 adenocarcinoma tumor models. Mice lacking XBP1s in DCs display increased melanoma tumor growth, reduced T cell effector responses and accumulation of terminal exhausted CD8 + T cells. Transcriptomic studies revealed that XBP1 deficiency in tumor cDCls decreased expression of mRNAs encoding XBPls and regulated IRE1 dependent decay (RIDD) targets. Finally, we find that the dysregulated melanoma growth and impaired T cell immunity noticed in XBP1 deficient mice are attributed to RIDD induction in DCs. This work indicates that IREl RNase activity in melanoma/MC38-associated DCs fine tunes aspects of antitumor immunity independently of XBP1s, revealing a differential role for the UPR axis that depends on the DC subtype and cancer model.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetEndoplasmic Reticulum Stress and Disease→Travaux en français237 207→