Diverse Monogenic Subforms of Human Spermatogenic Failure
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Non-obstructive azoospermia (NOA) is the most severe form of male infertility and typically incurable with current medicine. Due to the biological complexity of sperm production, defining the genetic basis of NOA has proven challenging, and to date, the most advanced classification of NOA subforms is based on simple description of testis histology. In this study, we exome-sequenced over 1,000 clinically diagnosed NOA cases and identified a plausible recessive Mendelian cause in 20%. Population-based testing against fertile controls identified 27 genes as significantly associated with azoospermia. The disrupted genes are primarily on the autosomes, enriched for undescribed human “knockouts”, and, for the most part, have yet to be linked to a Mendelian trait. Integration with single-cell RNA sequencing of adult testes shows that, rather than affecting a single cell type or pathway, azoospermia genes can be grouped into molecular subforms with highly synchronized expression patterns, and analogs of these subforms exist in mice. This analysis framework identifies groups of genes with known roles in spermatogenesis but also reveals unrecognized subforms, such as a set of genes expressed specifically in mitotic divisions of type B spermatogonia. Our findings highlight NOA as an understudied Mendelian disorder and provide a conceptual structure for organizing the complex genetics of male infertility, which may serve as a basis for disease classification more advanced than histology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».