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Enregistrement W4287378291 · doi:10.1038/s41598-022-16178-3

Polarimetric biomarkers of peri-tumoral stroma can correlate with 5-year survival in patients with left-sided colorectal cancer

2022· article· en· W4287378291 sur OpenAlexafffund
Jigar Lad, Stefano Serra, Fayez A. Quereshy, Mohammadali Khorasani, I. Alex Vitkin

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueOptical Polarization and Ellipsometry
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of VictoriaUniversity Health NetworkUniversity of British ColumbiaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchPrincess Margaret Hospital FoundationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity Health Network
Mots-clésStromal cellColorectal cancerStromaHistologyPopulationMedicineStage (stratigraphy)PathologyOncologyCancerInternal medicineBiologyImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Using a novel variant of polarized light microscopy for high-contrast imaging and quantification of unstained histology slides, the current study assesses the prognostic potential of peri-tumoral collagenous stroma architecture in 32 human stage III colorectal cancer (CRC) patient samples. We analyze three distinct polarimetrically-derived images and their associated texture features, explore different unsupervised clustering algorithm models to group the data, and compare the resultant groupings with patient survival. The results demonstrate an appreciable total accuracy of ~ 78% with significant separation (p < 0.05) across all approaches for the binary classification of 5-year patient survival outcomes. Surviving patients preferentially belonged to Cluster 1 irrespective of model approach, suggesting similar stromal microstructural characteristics in this sub-population. The results suggest that polarimetrically-derived stromal biomarkers may possess prognostic value that could improve clinical management/treatment stratification in CRC patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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