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Enregistrement W4287832638 · doi:10.1080/00288233.2022.2080721

Identification of the KAP27‐1 gene in sheep and its effect on wool traits

2022· article· en· W4287832638 sur OpenAlexaff
Huitong Zhou, Hua Gong, Kaiwen Zhang, Shaobin Li, Xiu Liu, Jiqing Wang, Yuzhu Luo, Jon G. H. Hickford

Notice bibliographique

RevueNew Zealand Journal of Agricultural Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSkin and Cellular Biology Research
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of QinghaiNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésWoolBiologyGeneSingle-nucleotide polymorphismGenotypeGeneticsSingle-strand conformation polymorphismCoding regionPolymorphism (computer science)Polymerase chain reactionGenetic variationNucleotide

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The keratin‐associated proteins (KAPs) are structural components of wool and hair fibres, with over 90 genes that encode these proteins having been identified in mammalian species. A KAP gene called KRTAP27‐1 was recently identified in goats, but the gene has not been reported in the closely related ruminant species sheep. In this study, we used a polymerase chain reaction‐single strand conformation polymorphism (PCR‐SSCP) analysis to find ovine KRTAP27‐1 and investigate nucleotide sequence variation in the gene. Our analysis revealed four sequence variants (named A to D ) in 399 New Zealand Merino × Southdown‐cross sheep. Within these sequence variants there were five single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the coding region, including two non‐synonymous SNPs. Six genotypes ( AA, AB, AC, BB, BC and BD ) of KRTAP27‐1 were detected, and for the three genotypes with a frequency of over 5.0%, sheep of genotypes AB and BB produced wool of higher mean staple length (MSL) and higher greasy fleece weight (GFW) than sheep of genotype AA . These results suggest that variation in ovine KRTAP27‐1 may be affecting wool growth and thus production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,349
Score d'incertitude au seuil0,231

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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