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Enregistrement W4288074845 · doi:10.1136/jnnp-2022-328921

Genotype–phenotype correlations in valosin-containing protein disease: a retrospective muticentre study

2022· article· en· W4288074845 sur OpenAlexafffund
Marianela Schiava, Chiseko Ikenaga, Rocío N. Villar‐Quiles, Marta Caballero‐Ávila, Ana Töpf, Ichizo Nishino, Virginia Kimonis, Bjarne Udd, Benedikt Schoser, Edmar Zanoteli, Paulo Victor Sgobbi de Souza, Giorgio Tasca, Thomas Lloyd, Adolfo Lopez-de Munain, Carmen Paradas, Elena Pegoraro, Aleksandra Nadaj-Pakleza, Jan De Bleecker, Umesh A. Badrising, Alicia Alonso‐Jiménez, Anna Kostera‐Pruszczyk, Francesc X. Miralles, Jin‐Hong Shin, Jorge A. Bevilacqua, Montse Olivé, Matthias Vorgerd, Rudi Kley, Stefen Brady, Timothy L. Williams, Cristina Domínguez‐González, George K. Papadimas, Jodi Warman‐Chardon, Kristl G. Claeys, Marianne de Visser, Nuria Muelas, Pascal Laforêt, Edoardo Malfatti, Lindsay N. Alfano, Sruthi Nair, Georgios Manousakis, Hani Kushlaf, Matthew Harms, Christopher Nance, Alba Ramos‐Fransí, Carmelo Rodolico, Channa Hewamadduma, Hakan Çetin, Jorge García‐García, Endre Pál, Maria Elena Farrugia, Phillipa J. Lamont, Colin Quinn, Velina Nedkova-Hristova, Stojan Peric, Sushan Luo, Anders Oldfors, Kate Taylor, Stuart H. Ralston, Tanya Stojkovic, Conrad C. Weihl, Jordi Díaz‐Manera

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurology Neurosurgery & Psychiatry · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute on AgingRoy J. and Lucille A. Carver College of Medicine, University of IowaSorbonne UniversitéCentro de Investigación Biomédica en Red sobre Enfermedades NeurodegenerativasTaysNational Center of Neurology and PsychiatryInstituto de Salud Carlos IIIOhio State UniversityGöteborgs UniversitetNational and Kapodistrian University of AthensMedizinische Universität WienFaculdade de Medicina da Universidade de São PauloInstitute of GeneticsUniversity of CincinnatiUniversidade de São PauloWarszawski Uniwersytet MedycznyKU LeuvenJohns Hopkins UniversityUniversità degli Studi di PadovaResearch Institute, Nationwide Children's HospitalFudan UniversityUniversitair Ziekenhuis GentUniversität WienNationwide Children's HospitalPusan National UniversityUniversiteit LeidenHuashan HospitalUniwersytet WarszawskiUniversiteit GentUniversity of PennsylvaniaUniversité de Versailles Saint-Quentin-en-YvelinesUniversità degli Studi di MessinaNewcastle UniversityAssistance publique-Hôpitaux de ParisPécsi TudományegyetemUniversity of MinnesotaUniversidad de ChileInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleUniversity of Oxford
Mots-clésMedicineFrontotemporal dementiaWeaknessDysautonomiaRetrospective cohort studyGenotypeDiseaseInternal medicineAge of onsetMuscle biopsyMuscle weaknessPediatricsDementiaSurgeryGeneticsGeneBiologyBiopsy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Valosin-containing protein (VCP) disease, caused by mutations in the VCP gene, results in myopathy, Paget’s disease of bone (PBD) and frontotemporal dementia (FTD). Natural history and genotype–phenotype correlation data are limited. This study characterises patients with mutations in VCP gene and investigates genotype–phenotype correlations. Methods Descriptive retrospective international study collecting clinical and genetic data of patients with mutations in the VCP gene. Results Two hundred and fifty-five patients (70.0% males) were included in the study. Mean age was 56.8±9.6 years and mean age of onset 45.6±9.3 years. Mean diagnostic delay was 7.7±6 years. Symmetric lower limb weakness was reported in 50% at onset progressing to generalised muscle weakness. Other common symptoms were ventilatory insufficiency 40.3%, PDB 28.2%, dysautonomia 21.4% and FTD 14.3%. Fifty-seven genetic variants were identified, 18 of these no previously reported. c.464G>A (p.Arg155His) was the most frequent variant, identified in the 28%. Full time wheelchair users accounted for 19.1% with a median time from disease onset to been wheelchair user of 8.5 years. Variant c.463C>T (p.Arg155Cys) showed an earlier onset (37.8±7.6 year) and a higher frequency of axial and upper limb weakness, scapular winging and cognitive impairment. Forced vital capacity (FVC) below 50% was as risk factor for being full-time wheelchair user, while FVC <70% and being a full-time wheelchair user were associated with death. Conclusion This study expands the knowledge on the phenotypic presentation, natural history, genotype–phenotype correlations and risk factors for disease progression of VCP disease and is useful to improve the care provided to patient with this complex disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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