Genotypic diversity and antifungal susceptibility of <i>Scedosporium</i> species from clinical settings in China
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Scedosporium species have drawn significant interest as inhabitants of polluted soil and water and as cause of high mortality in near‐drowning patients. So far, most cases have been reported from Europe and Australia, while knowledge on their prevalence and genotypic diversity from Asia is scant. Objectives To increase the knowledge of the genetic diversity and in vitro antifungal susceptibility of Scedosporium species involved in human infections from China. Methods Here, we applied the ISHAM‐MLST consensus scheme for molecular typing of Scedosporium species and revealed both high species diversity and high genotypic diversity among 45 Chinese clinical Scedosporium isolates. Results Among the five species, Scedosporium boydii ( n = 22) was the most common, followed by S. apiospermum ( n = 18), S. aurantiacum ( n = 4) and S. dehoogii ( n = 1). S. aurantiacum was reported for the first time from clinical samples in China. The predominant sequence types (STs) were ST17 in S. apiospermum , ST4 in S. boydii and ST92 in S. aurantiacum , including four novel STs (ST40, ST41, ST42 and ST43) in S. apiospermum . Based on the CLSI‐M38 A2 criterion, voriconazole was the only antifungal compound with low MIC values (MIC 90 ≤ 1 μg/ml) for all Scedosporium isolates in our study. Conclusions The genetic diversity of clinical isolates of Scedosporium species from China is extremely high, with S. boydii being predominant and S. aurantiacum being firstly reported here. VOR was the only antifungal compound with low MIC values for all Scedosporium isolates in our study, which should be recommended as the firstline antifungal treatment against scedosporiosis in China.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle