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Enregistrement W4288096016 · doi:10.1093/jcag/gwac025

C282Y/H63D Compound Heterozygosity Is a Low Penetrance Genotype for Iron Overload-related Disease

2022· article· en· W4288096016 sur OpenAlexaffabout
S. M. Mahmudul Hasan, James A. Farrell, Mark Borgaonkar

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensHealth Sciences CentreMemorial University of NewfoundlandUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPenetranceGenotypeCompound heterozygosityLoss of heterozygosityGeneticsBiologyMutationAlleleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Hereditary hemochromatosis (HH) occurs due to mutations in the HFE gene. While the C282Y mutation is the most common genotype reported in HH, other genotypes are found less frequently, indicating variable degrees of penetrance. We studied the penetrance of the C282Y/H63D compound heterozygote genotype in developing clinically significant iron overload. Methods We have completed a retrospective analysis on every individual within Newfoundland & Labrador who were diagnosed as C282Y/H63D compound heterozygote between 1996 and 2009 through a molecular genetics study. We collected data for up to 10 years following the initial genotyping using electronic health records, including laboratory values, phlebotomy status, radiologic reports and clinic records. Iron overload status was classified based on the HealthIron study. Results Between 1996 and 2009, 247 individuals with available health records tested positive for C282Y/H63D compound heterozygosity. Over the 10 years of our study, 5.3% of patients exhibited iron overload-related disease on the background of documented iron overload. Including these individuals, 10.1% of patients had documented iron overload, 23.1% of patients had a provisional iron overload and the remaining 66.8% of patients had no evidence of iron overload. Only 44 patients had documented phlebotomies, likely based on their severe phenotype at baseline. Despite phlebotomy, the prevalence of iron overload was higher among these patients. The penetrance of compound heterozygosity was also significantly higher among men (P < 0.01). Conclusion C282Y/H63D compound heterozygosity is a low penetrance genotype in HH. This is the largest reported cohort of C282Y/H63D compound heterozygotes in North America with an extended follow-up.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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