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Enregistrement W4288446285 · doi:10.1111/1365-2745.13972

Plant spectra as integrative measures of plant phenotypes

2022· article· en· W4288446285 sur OpenAlexafffund
Shan Kothari, Anna K. Schweiger

Notice bibliographique

RevueJournal of Ecology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueRemote Sensing in Agriculture
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesAlberta InnovatesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversität ZürichNational Science Foundation of Sri LankaCanadian Network for Research and Innovation in Machining Technology, Natural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta Innovates - Technology FuturesCanada Foundation for InnovationNational Aeronautics and Space AdministrationNational Science Foundation
Mots-clésTraitEcologyPlant communityCovariancePlot (graphics)BiologyStatisticsComputer scienceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Spectroscopy at the leaf and canopy scales has attracted considerable interest in plant ecology over the past decades. Using reflectance spectra, ecologists can infer plant traits and strategies—and the community‐ or ecosystem‐level processes they correlate with—at individual or community levels, covering more individuals and larger areas than traditional field surveys. Because of the complex entanglement of structural and chemical factors that generate spectra, it can be tricky to understand exactly what phenotypic information they contain. We discuss common approaches to estimating plant traits from spectra—radiative transfer and empirical models—and elaborate on their strengths and limitations in terms of the causal influences of various traits on the spectrum. Many chemical traits have broad, shallow and overlapping absorption features, and we suggest that covariance among traits may have an important role in giving empirical models the flexibility to estimate such traits. While trait estimates from reflectance spectra have been used to test ecological hypotheses over the past decades, there is also a growing body of research that uses spectra directly, without estimating specific traits. By treating positions of species in multidimensional spectral space as analogous to trait space, researchers can infer processes that structure plant communities using the information content of the full spectrum, which may be greater than any standard set of traits. We illustrate this power by showing that co‐occurring grassland species are more separable in spectral space than in trait space and that the intrinsic dimensionality of spectral data is comparable to fairly comprehensive trait datasets. Nevertheless, using spectra this way may make it harder to interpret patterns in terms of specific biological processes. Synthesis . Plant spectra integrate many aspects of plant form and function. The information in the spectrum can be distilled into estimates of specific traits, or the spectrum can be used in its own right. These two approaches may be complementary—the former being most useful when specific traits of interest are known in advance and reliable models exist to estimate them, and the latter being most useful under uncertainty about which aspects of function matter most.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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